Женская эрозия: Страница не найдена — Клиника ISIDA Киев, Украина

Женская консультация — Лечение лазером, радиоволновая хирургия

Лечение лазером, радиоволновая хирургия

В женской консультации есть кабинет лазерной хирургии, который оснащен современным высокоинтенсивным полупроводниковым лазером «ЛАЗЕРМЕД – 10».

С помощью данного аппарата осуществляется один из наиболее современных и эффективных способов лечения патологии шейки матки, влагалища и вульвы – лазеровапоризация.

Уникальные свойства лазерного луча обеспечивают несомненные преимущества по сравнению с традиционными методами лечения заболеваний шейки матки (электро икриовоздействия, химического и консервативного методов.

Высокоинтенсивный лазерный луч способен бесконтактно и безболезненно испарять и коагулировать ткани с образованием на поверхности тонкой пленки, препятствующей проникновению микробов в подлежащие ткани.

Остроконечные кондиломы наружных половых органов

Показаниями для применения диодного лазера являются:

• эрозии шейки матки,
• папилломы,
• дисплазии шейки матки 1ст,
• лейкоплакии,
• ретенционные кисты,
• полипы цервикального канала,
• папилломы вульвы и перианальной области,
• остроконечные кондиломы,
• эндометриоз.

Лечение осуществляется амбулаторно.

Лазерная вапоризация шейки матки производится на 7-8 день менструального цикла без обезболивания. Эпителизация завершается к 22-27 дню. Заживление тканей протекает безболезненно без образования рубцов.

Преимущества лазеровапоризации:

1. Высокая точность за счет использования кольпоскопа. Это дает возможность не только точно воздействовать лучем но и контролировать сам ход лазерного испарения, что обеспечивает полноеудаление патологического очага.
2. Минимальная кровопотеря. В большинстве случаев лазерные операции протекают бескровно.
3. Более быстраяэпителизация, что значительно уменьшает сроки заживления раны.
4. Минимальное повреждение окружающих и подлежащих тканей. Отсутствуют грубые рубцы и стенозы. Это позволяет применять лазерные методики для лечения у нерожавших женщин.

К нам в гинекологическое отделение приезжают люди из разных городов Юга и всей России: Краснодар, Ставрополь, Махачкала, Ингушетия, Владикавказ, Грозный, Волгоград, Якутия, Дальний Восток, Сочи, Хабаровск, Казань, Южно-Сахалинск и прочие города.

ВОПРОС – ОТВЕТ

• Надо ли лечить эрозию шейки матки?

  Эрозия – это нарушение нормального состояния эпителия шейки матки, которое может привести к серьезным осложнениям: более высокий риск воспалительных заболеваний, инфицирования ВПЧ, фон для развития предраковых заболеваний.
  
  Многие считают, что сейчас, как и в прошлом, молодым девушкам, а также женщинам, которые еще планируют иметь детей, не должны делать прижигание эрозии шейки матки, поскольку это создает риск развития рубцов. А эти образования делают шейку менее пластичной, что влияет на ее раскрытие в родах.
  
  Но современные методы терапии (лазерная вапоризация) позволяют устранить эрозию, не изменяя строение цервикального канала. Они эффективны, безопасны, их могут применять даже молодым девушкам, которые только планируют иметь детей.

• Эта процедура безопасна?

  Да!!

  По сравнению с другими технологиями (диатермокоагуляция, крио или химическая деструкция) лазер является максимально щадящей и в то же время наиболее эффективной процедурой.
  
  Воздействие лазером строго дозируется по глубине и площади – невозможно ошибиться и повредить соседние здоровые участки.
  
  Лечение лазером проводится под контролем кольпоскопии – увеличенное изображение на кольпоскопе помогает точно направить луч лазера.
  
  Лазерная коагуляция не оставляет рубцов и сужений цервикального канала – это самый щадящий метод лечения и приемлем для нерожавших девушек, у которых медикаментозное лечение оказалось неэффективным.

• Какие нужно сдавать анализы?

  До проведения лазерной вапоризации во избежание возможных осложнений необходимо пройти ряд обязательных обследований: анализы на инфекции половых путей методом ПЦР, на наличие ВПЧ и его тип, общий мазок, онкоцитологию , расширенную кольпоскопию, биопсию шейки матки, а также анализ крови на RW, ВИЧ, ОАК.
  
  Только при наличии результатов этих исследований гинеколог может делать выводы о возможности лазерной вапоризации.
  
  Внимание! NEW! Диагностика рака и предрака шейки матки на сканере «TRUSCREEN».
  
  Для прохождения регулярного гинекологического осмотра и скрининга по раннему выявлению патологии шейки матки Вы можете пройти обследование на диагностическом сканере TruScreen. Это новейшая уникальная оптико-электронная технология позволит врачу гинекологу в течение нескольких минут оценить состояние тканей шейки матки в режиме реального времени.
  
  Внимание! NEW! Диагностика рака и предрака шейки матки на сканере «TRUSCREEN».
  
  Процедура обследования абсолютно безболезнена. Врач –гинеколог легкими прикосновениями специального зонда к поверхности шейки матки тестирует необходимое количество точек, после чего сканер автоматически распечатывает проанализированные данные. В некоторых случаях сканирование в сочетании с цитологическим исследованием позволяет избежать инвазивных методов диагностики – биопсии шейки матки, что особенно важно для нерожавших женщин.

• Лазерная вапоризация – это не больно?

  В отличии от других методов, лазеровапоризация шейки матки не причинит Вам какой либо выраженной боли, поскольку сопровождается только небольшими тянущими ощущениями внизу живота, возникающими в результате рефлекторного сокращения матки.

• Как проводится?

  На 7-8 день цикла в основном без предварительного обезболивания. Сама процедура занимает в среднем 20 – 25 мин.

• Реабилитация.

  После лазерной вапоризации пациентка может испытывать небольшой дискомфорт внизу живота. Через 7-10 дней возможны умеренные кровянистые выделения из половых путей.
  
  Рекомендуется половое воздержание в течении 3-4 недель, ограничение физической нагрузки в первые 2 недели, исключить посещения сауны,бани.Спустя 4-5недель после процедуры следует повторить кольпоскопическое и цитологическое обследование для оценки эффективности вапоризации.

ВАЖНО: женщинам, у которых наблюдались патологические изменения шейки матки, минимум 1 раз в год следует проходить профилактический осмотр у гинеколога с обязательным цитологическим исследованием.

Лечение эрозии шейки матки в Омске

Оплата приема происходит в клинике. Запись к врачу без комиссий и переплат.

Акушер,

гинеколог

Стаж 25 лет

1 категория

В клинике

от 1 000₽

Запись на приём:

(3812) 29-00-72

Клиника «Статус Ре-Эйдж» (ранее «Клиника Зубарева»)

Запись на приём

Как клиника работает в условиях эпидемии COVID-19?

Акушер,

врач УЗИ,

гинеколог,

репродуктолог

Стаж 18 лет

В клинике

от 700₽

Запись на приём:

(3812) 90-60-16

Клиника «Мать и дитя» (Омский центр репродуктивной медицины)

Запись к врачу недоступна

Как клиника работает в условиях эпидемии COVID-19?

Запись к врачу недоступна

Акушер,

гинеколог,

репродуктолог

Стаж 11 лет

В клинике

от 1 350₽

Запись на приём:

(3812) 90-60-16

Клиника «Мать и дитя» (Омский центр репродуктивной медицины)

Запись на приём

Как клиника работает в условиях эпидемии COVID-19?

Акушер,

гинеколог

Только пациенты старше 18 лет!

Клиника «Класс Клиник»

Запись к врачу недоступна

Как клиника работает в условиях эпидемии COVID-19?

Гинеколог

Стаж 9 лет

В клинике

от 800₽

Запись на приём:

(3812) 21-46-04

Только пациенты старше 18 лет!

Клиника «Класс Клиник»

Запись на приём

Как клиника работает в условиях эпидемии COVID-19?

Акушер,

гинеколог

Клиника «Класс Клиник»

Запись к врачу недоступна

Как клиника работает в условиях эпидемии COVID-19?

Гинеколог

Стаж 24 года

Высшая категория

В клинике

от 800₽

Запись на приём:

(3812) 90-61-33

Женская консультация роддома №6 на Перелета

Медицинский центр «Гирутек» на Дианова

Роддом №6

Запись к врачу недоступна

Запись к врачу недоступна

Как клиника работает в условиях эпидемии COVID-19?

Запись к врачу недоступна

Гинеколог

Стаж 13 лет

1 категория,

к. м.н.

МСЧ №9

Запись к врачу недоступна

Акушер,

гинеколог

Стаж 25 лет

1 категория

В клинике

от 1 000₽

Запись на приём:

(3812) 29-00-72

Клиника «Статус Ре-Эйдж» (ранее «Клиника Зубарева»)

Поликлиника городской больницы №2

Запись к врачу недоступна

Как клиника работает в условиях эпидемии COVID-19?

Запись к врачу недоступна

Гинеколог,

маммолог

Стаж 23 года

Высшая категория,

к. м.н.

Только пациенты старше 18 лет!

Роддом №6

Запись к врачу недоступна

Врач УЗИ

Стаж 29 лет

Высшая категория

Городская больница №8

Запись к врачу недоступна

Акушер,

врач УЗИ,

гинеколог,

гинеколог-эндокринолог

Стаж 34 года

Высшая категория

Женская консультация Западно-Сибирского медицинского центра ФМБА

Лечебно-диагностический центр «Здоровье»

Запись к врачу недоступна

Запись к врачу недоступна

Гинеколог

Стаж 8 лет

2 категория

Поликлиника КМХЦ (МСЧ №10)

Запись к врачу недоступна

Лечение эрозии шейки матки | Клиника Доктор Озон

Эрозия шейки матки

Эрозия шейки матки одно из самых распространенных женских заболеваний. Суть — нарушение целостности выстилающего покровного эпителия.

Чаще всего заболевание обнаруживают при осмотре гинеколога, когда женщина приходит абсолютно по другому поводу, так как симптомов характерных для эрозии шейки матки — нет.

Как же обнаружить эрозию?

Обнаружить эрозию врачу легко: для этого достаточно простого осмотра в гинекологических зеркалах. Эта манипуляция проводится каждым гинекологом. Для уточнения диагноза на шейку матки наносят очень слабые растворы йода или уксусной кислоты. «Правильные» и «неправильные» участки слизистой оболочки реагируют на эти вещества по-разному: пораженная слизистая всегда выглядит более светлым участком, так как плохо окрашивается. Это дает возможность определить более четко границы и размеры эрозии и определить метод и тактику лечения.

Если при наличии заболевания ничего не делать и пустить дело на самотек, при наличии «отягчающих обстоятельств и факторов риска», лет через 7-15 возможно перерождение в злокачественное заболевание. Поэтому само наличие заболевания — повод четко следовать указаниям врача и пройти лечение в Москве.

Почему возникает?

Эрозия чаще всего возникает при гормональных нарушениях (скудные или нерегулярные или очень болезненные менструации), при носительстве инфекций, передающихся половым путем (особое место среди них занимает хламидиоз и папилломавирус), механические травмы (после родов, абортов, длительном ношении внутриматочных спиралей). Поэтому обследование и лечение (например, прижигание эрозий шейки радиоволнами — сургитроном) достаточно разнообразно и подбирается индивидуально.

Лечение эрозии шейки матки Сургитроном — прижигание радиоволнами

Первая и самая основная цель при обнаружении эрозии — это ее удаление. Способов это сделать достаточно, от самого древнего — диатермокоагуляции (то есть прижигание эрозии шейки матки электричеством), до криодеструкции и радиоволнового лечения (например, при помощи «Сургитрона»).

Если эрозия не большая и женщина не рожала, рекомендуются наименее травматичные методы — криокогаугялция, радиоволновое лечение при помощи аппарата «Сургитрон». При обширных эрозиях после родов, особенно, если есть кисты на шейки матки, желательно выбрать способ дающий возможность прижечь не только нужный участок, но и другие очаги и элементы — это диатермокоагуляция и радиоволновое лечение.

Как определить метод лечения?

Для того чтобы точно определить каким способом лечить данную эрозию (прижигание на шейке матки или другой) врачу необходимо очень внимательно осмотреть шейку матки под микроскопом. Такой вид исследование называется кольпоскопия . Взять анализ на структуру клеток (цитология) и структуру тканей (гистология). Эти виды исследований абсолютно безболезненны! Не пренебрегайте данными исследованиями, сделайте все необходимое как того требует правила, — и результат лечения будет с первого раза и навсегда!

Опять эрозия!

Сколько женщин рассказывает, что им приходилось не один раз прижигать эрозию, и эрозия не заживала. Возвращаю Вас к причинам возникновения эрозии. Если механическое повреждение прижигание устраняет, то первые причины — нет. Рецидив (возврат) эрозии шейки матки – это повод глубоко обследоваться на вирусоносительство, вылечить воспалительный процесс в женской половой сфере, вылечить зубы (!) и вспомнить про тонзиллит, «гнойные пробки в горле» и несостоявшийся визит к ЛОРу в Москве. Да, да, все в человеческом организме взаимосвязано! Низкая «заживляемость» эрозии часто связана с наличием воспалительных заболеваний, ослабляющих организм в целом.

Что же надо делать, чтобы избежать эрозии шейки матки?

Во-первых, поставьте надежный заслон для проникновения вирусов в Ваш организм: вовремя посещайте стоматолога и ЛОРа; лечите все очаги инфекций; не худейте до безумия и не придерживайтесь строгих вегетарианских диет, чтобы уровень женских половых гормонов был достаточно высоким; следите за регулярностью менструального цикла и не проявляйте легкомыслия в сексе — настаивайте на использовании презервативов вашими партнерами. Ничего более надежного для профилактики инфекций еще не придумали. Во-вторых, избегайте травмирования шейки матки (основная причина — это аборты). В-третьих, посещайте гинеколога и проходите осмотр не реже 1 раза в 6 месяцев в Москве.
В нашей клинике накоплен богатый опыт радиоволнового лечения эрозий шейки матки прижиганием (Сургитроном), сопряженных с вирусоносительством, воспалительными заболеваниями женской половой сферы и гормональными нарушениями. В любой из клиник вы можете пройти все необходимое обследование, в том числе и видеокольпоскопию — новейшую методику диагностики заболеваний шейки матки. Широкое использование озона даст возможность в некоторых случаях обойтись без антибиотиков и дорогих противовирусных препаратов. При необходимости Вас проконсультирует гинеколог-эндокринолог, ЛОР и терапевт.

Эрозия шейки матки – гинекология в медицинском центре ОН Клиник

Среди различных патологий женских половых органов эрозия шейки матки встречается намного чаще, чем какие-либо другие заболевания. Нередко можно наблюдать такую ситуацию, когда придя на прием к врачу-гинекологу совершенно по другому вопросу, у женщины диагностируют и это заболевание.

Что такое эрозия шейки матки?

В гинекологии эрозия шейки матки – это дефект покровного эпителия шейки матки, который покрывает влагалищную часть шейки матки. По сути, она представляет собой воспалительный процесс, который сопровождается покраснением. Что такое эрозия шейки матки, к сожалению, знают многие женщины. Эта болезнь — не редкость для прекрасного пола в любом возрасте, особенно в детородном. При этом болезнь эрозия шейки матки после родов проявляется у женщин так же часто, как и у девушек. Зачастую это доброкачественное заболевание. Однако несвоевременность ее устранения может усугубить ситуацию и вызвать предраковое состояние.

Все об эрозии шейки матки в гинекологии вы сможете узнать у опытных гинекологов медицинского центра «ОН Клиник». Запишитесь на консультацию сейчас, мы окажем квалифицированную и своевременную помощь

Причины возникновения

Причинами ее появления выступают разные факторы:

• механические повреждения;
• вирусные инфекции;
• хронические заболевания половых органов.

Как передается? Внимание! Генетическим путем это заболевание не передается. Исключение составляет только врожденная эрозия, которая может возникнуть у любой женщины.

Не менее опасным является сочетание ВПЧ и эрозия матки. Это объясняется тем, что в большинстве случаев такая «дружба» приводит к раку шейки матки. В тяжелой стадии может даже открыться кровотечение наряду с болями во влагалище. Однако в такой ситуации не стоит опускать руки. Подбор современных методов лечения и детальный анализ поможет выявить самый результативный вариант решения проблемы.

Диагностика заболевания

При диагностике заболевание можно выявить на первичном осмотре. Для подтверждения диагноза гинеколог может назначить дополнительное обследование и определить противопоказания выбранных лекарственных средств на организм. Это поможет подобрать правильное и результативное лечение.

Перед началом лечения все пациенты «ОН Клиник» проходят первичный осмотр, который включает в себя:

• консультацию квалифицированного врача;
• сбор истории болезни;
• полный комплекс всех необходимых обследований.

Данный подход является очень удобным в первую очередь для самих пациентов, так как им не придется разрываться между домом, работой и своим здоровьем, чтобы выделить день для очередного осмотра. Уже при первом посещении можно пройти полный комплекс всех обследований с постановкой диагноза и приступить к лечению.

Виды заболевания эрозии шейки матки

Выделяют такие виды заболевания у женщин:

• врожденная эрозия шейки матки развивается из-за эктопии границ цилиндрического эпителия во время внутриутробного развития плода. Она проявляется в детском или подростковом возрасте;
• гормональная эрозия шейки матки — из-за сильных гормональных изменений в организме, когда плоский эпителий заменяется цилиндрическим;
• железистая эрозия шейки матки у женщин, которую именуют псевдоэрозией. Она может появиться на несколько месяцев или лет, если вовремя ее не устранить;
• послеродовая эрозия шейки матки, которая чаще всего появляется из-за сильного механического повреждения матки во время родов.

Помните: на фоне эрозии может появиться дисплазия шейки матки. Она может привести к раковым образованиям. Поэтому медлить с лечением независимо от вида этой болезни — нельзя. Ее наличие — свидетельство воспалительного процесса во влагалище.

Квалифицированные врачи «ОН Клиник» выяснят, почему возникает эрозия, и назначат действенное лечение без осложнений или последствий для женского здоровья. Все изменения шейки матки у девушек, которые собираются стать матерями в будущем, будут под контролем опытных гинекологов.

Удаление эрозии шейки матки радиоволнами в «ОН Клиник»: основные стадии болезни

Различают такие стадии эрозии шейки матки:

• легкая — повреждена только малая часть;
• средняя — воспаление распространено на половину шейки матки;
• тяжелая — большая часть находится под воспалением с ярко выраженной красной окраской.

Поражение шейки матки всегда имеет четкую границу. Гинеколог проводит специальные измерения степени и глубины поражения для определения эффективного метода лечения. При этом все стадии (степени болезни) обязательно исследуют на наличие онкологии. Особенно опасным считают место стыка двух слоев эпителия или границу эрозии.

Чем грозит эрозия шейки матки?

Последствия болезни:

• невынашивание плода;
• тяжелые роды;
• женское бесплодие;
• дисплазией и онкологией, что ведет за собой удаление матки.

В общих случаях эрозия и дисплазия шейки матки у девушек проявляется в детородном возрасте, а у женщин старшего возраста риск ее появления повышается в несколько раз. К основным причинам ее возникновения можно отнести использование внутриматочных контрацептивов и гиперактивную половую жизнь.

В «ОН Клиник» применяется радиоволновое лечение эрозии шейки матки прибором «Сургитрон». Это уникальная современная методика, в ходе которой Вы сможете избавиться от патологии без боли и необходимости госпитализации уже на первом сеансе ее применения. Сама процедура представляет собой прижигание эрозии шейки матки направленным пучком радиоволн. Радиоволновое излучение фокусируется точно на проблемных участках, никак не затрагивая здоровые.

Примечателен тот факт, что радиоволновая терапия или хирургия эрозии шейки матки является атравматическим методом хирургии. Удаление эрозии шейки матки прибором «Сургитрон» не повреждает здоровые ткани организма, а используемое радиоволновое излучение является полностью безопасным для здоровья человека. Все пациенты, прошедшие данную процедуру, которая длится всего несколько минут, находятся под наблюдением врача медицинского центра, а также проходят гистологическое и цитологическое обследование.

Благодаря своей уникальности данная методика позволяет провести прижигание эрозии радиоволновым методом без осложнений и последствий, что тоже немаловажно, особенно для нерожавших женщин. Прибор «Сургитрон» не оставляет после себя рубцов и не нарушает анатомическое строение шейки матки, которая остается такой же эластичной. Это позволяет избежать возможных разрывов тканей во время последующих родов.

Удаление эрозии шейки матки радиоволнами совершенно безопасно и откладывать эту процедуру нельзя. В «ОН Клиник» вы получите полный и своевременный комплекс услуг по лечению эрозии шейки матки без операции. Услуга доступна во всех городах нашей сети: Днепропетровске, Харькове, Сумах, Полтаве и остальных. А наши гинекологи знают, что можно сделать, чтобы избежать осложнений и последствий. Цены на лечение можно узнать по контактным телефонам. Помните: цена зависит от степени повреждения и стадии. С нами вы сможете быстро забыть о своей проблеме и снова быть здоровой!

Кольпоскопия – что это за операция и как к ней подготовиться :: Первая гинекологическая клиника в Красноярске, женская гинекология

Опубликовано 21.06.2019

Рак шейки матки — основная причина смертности женщин в возрасте от 30 до 35 лет. При этом женщина зачастую не может самостоятельно обнаружить патологию, испытывая незначительные жалобы.

Шейка матки имеет особое анатомическое строение. Она устроена таким образом, что гинеколог может увидеть только грубые изменения шейки матки, которые, как правило, являются показателем запущенного процесса. Более детально рассмотреть шейку матки на предмет патологии возможно только под большим увеличением, которое, как раз, и обеспечивает прибор под названием кольпоскоп.

Что такое кольпоскопия

Эта диагностический метод исследования слизистой вульвы, влагалища и шейки матки с помощью специального оптического прибора – кольпоскопа. Процедура является современным, безболезненным и низко затратным методом диагностики шейки матки. При выявлении патологий женской половой системы без кольпоскопии порой не обойтись.

Кольпоскопия позволяет выявить злокачественные, предраковые и доброкачественные патологии шейки матки. При этом при кольпоскопии гинеколог может дополнительно взять соскоб на цитологический анализ, если во время осмотра возникли подозрения или женщина находится в группе риска по возникновению раковых заболеваний.

Многие девушки, у которых есть эрозия шейки матки без напоминаний обращаются к гинекологу и проходят необходимое обследование. Так же о своем здоровье должна заботится каждая девушка, даже при отсутствии патологии, не реже 1раза в год.

Кольпоскопия позволяет увидеть незначительные изменения шейки матки, даже когда на первый взгляд она выглядит абсолютно здоровой. Окрашивание различными красителями помогает выявлять те патологические изменения, которые невозможно рассмотреть при визуальном осмотре шейки матки доктором.

Особенности кольпоскопии

Эта процедура абсолютна безболезненна, напоминает осмотр на кресле, возможно появление небольших неприятных ощущений, которые быстро проходят.

Пациент ложится на гинекологическое кресло, далее с помощью гинекологического зеркала обнажается шейки матки и к необходимой зоне обследования на расстоянии около 30см подводят кольпоскоп. Он представляет собой микроскоп, который подсоединен к экрану. На экране врач видит структурные и анатомические части шейки матки в высоком разрешении. Увеличенное изображение высокого качества позволяет отличить патологию от нормы.

Проведение процедуры возможна в любой день менструального цикла. Период проведения исследования индивидуален и зависит от длительности менструального цикла, но в некоторых случаях и по рекомендации врача рекомендуется проходить процедуру до 10 дня менструального цикла. Проведение кольпоскопии во время менструации невозможно.

При осмотре врач увидит нормальное состояние шейки матки или измененное. Некоторые виды «эрозии» относятся к норме, они требуют регулярного обследования и не нуждаются в «прижигании». При выявлении патологических процессов гинеколог назначает взятие биопсии или анализы на бактериальные и вирусные инфекции.

Зачем проводят кольпоскопию

Чтобы быстро выявить раковые и предраковые заболевания. Пациентке сначала делают пробу по Папаниколау. При выявлении атипичных клеток при цитоморфологическом исследовании мазков назначается биопсия шейки матки.

Если пациентка проходит лечение доброкачественных изменений со стороны шейки матки, вульвы или влагалища, врач назначает кольпоскопию в динамике для контроля эффективности этого лечения.

Как подготовиться к процедуре

Для данной процедуры нет необходимости менять рацион питания, специально брать отпуск или выходные. Т.е. никакой специальной подготовки не требуется. Главное — тщательно следить за гигиеной влагалища и не применять вагинальные средства за 3-4 дня до процедуры.

В течение двух дней до начала исследования разрешается половой акт только в презервативе. Также не рекомендуется использование вагинальных свечей, таблеток, антибактериальных и противогрибковых препаратов, любых медикаментов местного применения. Исключите спринцевание за двое суток до посещения врача.

Процедуру не назначают девушкам без опыта половой жизни, за исключением серьезных показаний и видимых отклонений в стационарном обследовании.

Не стоит бояться данного обследования, так как оно полностью безболезненно и не вызывает осложнений. Напротив, всего 15 минут в кабинете врача могут спасти вашу жизнь. Раковые изменения на ранних стадиях порой невозможно отличить от нормы при обычном гинекологическом осмотре.

Совместно с проведением кольпоскопии врач должен назначить исследование мазков.

Проводят ли кольпоскопию беременным

Гинекологи советуют проводить данное обследование до зачатия ребенка. Если показания к исследованию выявлены во время беременности, это может означать, что зачатие наступило на фоне развивающегося заболевания. Хотя это не всегда подтверждается.

Это безопасная процедура, если соблюдать главные правила этого обследования при беременности:

• Не проводить его на ранних сроках, так как велик риск самопроизвольного аборта;
• Биопсия берется в обязательном порядке при подозрении на злокачественные опухоли;
• Не стоит пугаться сукровичных выделений в течение 5 суток после посещения доктора, при этом они должны быть скудными и не причинять сильную боль.

Кольпоскопия во время беременности не только выявляет раковые и предраковые состояния, но и помогает контролировать ход заболевания, так как не все методы лечения разрешены при беременности.

В течение нескольких дней после процедуры пациентка получает результаты. Лечащий врач прописывает вагинальные свечи и другие лекарственные средства, которые разрешены во время беременности. При небольших отклонениях врач не назначает медикаментозных препаратов — только регулярное наблюдение. После родов назначается повторное обследование.

Какие действия необходимы после процедуры

В течение нескольких дней после обследования возможны небольшие выделения, рекомендуется применять ежедневные средства гигиены. В остальном, женщине нет необходимости изменять привычный образ жизни, питание или отказываться от спорта.

Если брали биопсию… 14 суток после

• Нельзя принимать препараты, в составе которых есть ацетилсалициловая кислота;
• Нельзя делать спринцевания, принимать ванны, посещать сауны и бани;
• Откажитесь на время от тампонов.
• Ограничьте половую жизнь.

При появлении температуры и других нетипичных симптомов, обратитесь к врачу.

При частых аллергических реакциях, следует проверить реакцию организма на раствор уксуса и раствор Люголя. Иногда наблюдается аллергическая реакция, а также цервицит и вагинит.

В наше время различные патологии шейки матки считаются одним из самых распространенных недугов женской половой системы. Из ряда онкологических заболеваний раковые и предраковые состояния шейки матки уступают лишь раку молочной железы.

Кольпоскопия помогает на ранних стадиях выявить патологию и быстро решить проблему. Важно регулярно проходить осмотр гинеколога даже без видимых жалоб. При отклонении мазков по Папаниколау врач назначает биопсию, которая диагностирует проблему на любых стадиях.

Важный совет при проведении кольпоскопии — правильно подбирайте гинекологическую клинику или отделение, читайте отзывы о врачах, узнавайте мнение знакомых.

Имеются противопоказания, необходима консультация специалиста

Список статей

Лечение эрозии шейки матки в Ростове-на-Дону, радиволновая эксцизия

Шейка матки – это часть матки, выступающая во влагалище. Это единственная часть половой системы женщины, доступная непосредственному осмотру. И тем не менее именно на этой части развивается самая частая злокачественная опухоль женской половой системы (кроме молочных желез) – рак шейки матки. Причиной чаще всего является недостаточный объем мероприятий, используемых при обнаружении эрозии шейки матки.

Заболевания шейки матки

Причина частых заболеваний и эрозии шейки матки связана с ее анатомическим расположением – она выступает во влагалище, поэтому при любой инфекции воспаление переходит на нее. Внутри шейки матки проходит канал, соединяющий ее с полостью матки. Стенки этого канала выстланы так называемым цилиндрическим эпителием, клетки которого являются идеальным местом жительства большинства бактерий и вирусов. Поэтому даже при излечении инфекции влагалища (кольпит, вагинит) внутри канала шейки матки возбудители могут оставаться.

Эрозия шейки матки, состоящая целиком из цилиндрического эпителия, поддерживает воспаление, поэтому при ее наличии часто бывает недостаточно ограничиться приемом антибиотиков, необходимо убрать сам очаг инфекции. Во время полового акта шейка матки травмируется, и повышается риск передачи инфекции.

Большинство инфекций, возбудители которых поражают шейку матки, передаются именно половым путем. Поэтому основной профилактикой воспалительных заболеваний, эрозии и рака шейки матки является использование презерватива, даже если контрацепция достигается другим способом (например, противозачаточными таблетками).

Наличие нескольких половых партнеров повышает риск развития заболеваний шейки матки, так как увеличивает нагрузку на иммунную систему женщины. Длительное существование воспаления приводит к изменению свойств клеток и повышению скорости их деления, что может привести к образованию опухоли – сначала доброкачественной, затем злокачественной. Половым путем передаются и вирусы – генитального герпеса и папилломы человека, роль которых в развитии рака шейки матки доказана.

Рак шейки матки

Рак шейки матки – самая частая злокачественная опухоль женских половых органов, если не считать молочной железы.

Средний возраст возникновения рака шейки матки – в районе 40 лет, но из-за того, что женщины регулярно посещают гинеколога, в этом возрасте частота рака начинает снижаться (патология шейки матки обнаруживается и лечится раньше), а вот у молодых женщин до 35 лет она резко возросла за последние 10 лет (потому что боятся лечиться).

Любая патология шейки матки при длительном нелеченном или неправильно леченном существовании может перейти в рак шейки матки.

Лечения патологии

Современный метод лечения патологии шейки матки – это ее удаление хирургическим лазером. В отличие от диатермокоагуляции, предлагаемой в женских консультациях, лазерное удаление патологии (папиллом, кондилом) не оставляет рубцов на шейке, и показан нерожавшим женщинам. Это единственный метод лечения, который позволяет убрать патологию под контролем глаза на ту глубину, на которую необходимо, а это позволяет избежать повторения (рецидива) патологии из-за того, что ее не до конца убрали.

Патология шейки матки почти никак себя не проявляет. Симптомы, которые требуют Вашего обращения к гинекологу: выделения любые, но особенно сукровичные и особенно появляющиеся после полового акта. Помните общий принцип медицины: лечатся те болезни, которые только начинаются или вообще еще не существуют. Идите к врачу, когда вас ничто еще не беспокоит. Не дожидайтесь симптомов.

Итак, Вы пришли к специалисту по патологии шейки матки.

Осмотр шейки матки

Когда женщина оказывается в гинекологическом кресле, врач в первую очередь осматривает наружные половые органы, а затем приступает к исследованию шейки матки. После вставления зеркала на шейку матки направляют свет и осматривают ее невооруженным глазом. При этом видны только грубые нарушения, их невозможно отличить друг от друга, они одинаково выглядят как участок покраснения, который называют эрозия шейки матки. После этого врач должен взять мазки на флору и цитологию, а затем произвести расширенную кольпоскопию.

Бактериологическое исследование

Это исследование мазка из влагалища и шейки матки под микроскопом. В мазке подсчитывают количество лейкоцитов (более 10-20 d в поле зрения говорит о наличии инфекции) и ищут возбудителей этой инфекции. Реально по мазку можно обнаружить грибы (молочница, кандидоз), «ключевые клетки» (бактериальный вагиноз, гарднереллез), изменение нормальной флоры. Если мазок показывает наличие инфекции, но не выявляет возбудителя, показаны посев и ПЦР-диагностика.

Лечение инфекции обязательно должно предшествовать лечению эрозии.

Цитологическое исследование

Обязательный этап диагностики патологии эрозии шейки матки. Обязательное исследование, проводимое перед ее лечением. Даже если ничего не беспокоит, и невооруженным глазом шейка матки кажется неизмененной, женщина должна регулярно (каждый год) проходить цитологическое исследование соскоба шейки матки. Цитология – это наука о клетке. При цитологическом исследовании изучают особенности строения клеток поверхности шейки матки. Результат исследования зависит от квалификации цитолога (того, кто смотрит в микроскоп) и правильности забора материала.

Мазок на цитологическое исследование берется специальным инструментом – шпателем. Он имеет изогнутую поверхность, соответствующую форме шейки матки. Мазок берут с нажимом, соскабливая слои клеток. Это совершенно безболезненная процедура. Дело в том, что злокачественный процесс начинается с нижних слоев эпителия (покровной ткани) шейки матки и прогрессирует вверх, к поверхности. Поэтому, если в мазок попадает только поверхностный слой, диагноз можно поставить только когда заболевание находится уже на последней стадии. Соскоблив клетки с определенного участка шейки матки – места стыка покровного эпителия, находящегося снаружи, и цилиндрического эпителия, выстилающего канал шейки матки изнутри, их распределяют на стекле.

Диагноз цитолога может звучать «атипические клетки не обнаружены» — норма или «обнаружены». Атипические клетки – это измененные по форме, размерам, строению ядер клетки. Изменения могут быть вызваны злокачественным процессом или воспалением. Поэтому противовоспалительное лечение проводят в любом случае, а данные цитологии дополняют проведением биопсии под контролем кольпоскопии.

Определение типа вируса папилломы человека

Иногда врач предлагает провести исследование для определения типа вируса папилломы человека (для его дальнейшего удаления). Дело в том, что некоторые виды патологии шейки матки вызываются именно этим вирусом, а некоторые его типы (16, 18) являются высокоонкогенными, т.е. с большой долей вероятности вызывают рак шейки матки. Поэтому при незначительном поражении можно определить тип вируса, и высокоонкогенный удалять, а низкоонкогенный наблюдать. При серьезной кольпоскопической патологии ее удаляют независимо от типа вируса, в этом случае его можно не определять. Определение типа вируса производится с помощью ПЦР-диагностики. Для этого из шейки матки специальной щеточкой берется еще один мазок.

Кольпоскопия

Это исследование шейки матки под микроскопом. Специальный микроскоп, позволяющий изучать внешний вид шейки матки, называется кольпоскоп, а процедура – кольпоскопией. Специалист по патологии шейки матки производит расширенную кольпоскопию – т.е. осмотр шейки матки под микроскопом после ее обработки специальными красящими растворами (содержащими уксусную кислоту и йод).

Вы лежите на гинекологическом кресле, зеркало введено, врач придвигает к креслу большой прибор с окулярами, включает лампочку и смотрит. Это и есть кольпоскоп. Он остается снаружи, его увеличение позволяет видеть шейку матки издали.

Процедура кольпоскопии достаточно долгая (около 20 мин), врач делает ее сидя и молча. Поэтому приготовьтесь к долгому лежанию и не спрашивайте врача, что там. Точно ответить он Вам сможет только когда проведет полностью расширенную кольпоскопию.

Первый красящий раствор, которым обрабатывают шейку матки, — 3% раствор уксусной кислоты. Он имеет специфический запах и может вызывать некоторое пощипывание, совершенно терпимое. Уксусная кислота приводит к спазму сосудов, что позволяет врачу рассмотреть саму шейку матки, а не ее сосудистую сеть. До окраски уксусной кислотой шейка выглядит как большое розовое пятно, после — вся имеющаяся патология четко выделяется. Уксусную кислоту врач наливает в зеркало из баночки, а затем ваткой промокает шейку матки и смотрит в кольпоскоп.

Следующий раствор – т.н. раствор Люголя. В его состав входит йод, только не спиртовой раствор, а водный, поэтому Люголь не щиплет вовсе. Нормальные, здоровые клетки шейки матки окрашиваются раствором Люголя, а патологически измененные – нет. Поэтому эта процедура необходима, чтобы четче увидеть границы патологии.

Если обработка растворами вызывает сильное жжение – это признак воспалительного процесса. Концентрации растворов рассчитаны не на ощущения, а только на окраску. Только воспаленная ткань имеет такую повышенную чувствительность.

Только расширенная кольпоскопия может помочь поставить точный диагноз заболевания шейки матки и определить его злокачественность; если она не была сделана, диагноз неизвестен. Эрозия — это не изученное красное пятно, под которым может скрываться все, что угодно. Кольпоскопист не пользуется этим словом, он ставит диагноз, пользуясь общепринятыми в мире терминами.

Без проведения расширенной кольпоскопии нельзя лечить эрозию, т.к. неизвестно, что лечить и насколько это опасно. После проведения расширенной кольпоскопии специалист по патологии шейки матки при необходимости берет прицельную (под контролем микроскопа) биопсию из подозрительных на вид участков.

Гистологическое исследование позволяет поставить окончательный диагноз. Главное в гистологическом диагнозе – наличие или отсутствие дисплазии. Дисплазия – это нарушение строения ткани. Она бывает трех степеней. Дисплазия 1 степени может быть как началом опухолевого процесса, так и следствием воспаления. Лечат инфекцию и повторяют биопсию. Дисплазия 2 и 3 степени – предраковые заболевания, требующие хирургического лечения.

Методы лечения

Именно по результатам гистологического исследования выбирают метод лечения эрозии шейки матки.

Химическое удаление

Возможно только при эктопии или кондиломах. Другие патологические процессы являются более глубокими, недоступными для проникновения кислот из химического препарата, поэтому при применении этого метода у женщин с более глубокими поражениями шейки матки часто изменения остаются и прогрессируют. Чаще всего применяют препарат Солковагин. Им прижигают поврежденный участок в несколько приемов (несколько дней)

Диатермокоагуляция (электрокоагуляция)

Основной метод лечения патологии шейки матки в женских консультациях. Самый болезненный, длительный и дает больше всего осложнений. Не показан у нерожавших женщин, так как вызывает сужение канала шейки матки рубцами, что во время родов может послужить причиной разрыва шейки. После диатермокоагуляции («прижигания») шейка заживает больше месяца, поэтому следующая менструация наступает раньше, чем образуется нормальный эпителий. Выделяющиеся клетки эндометрия, контактируя с раневой поверхностью, могут осесть на ней и способствовать развитию эндометриоза шейки матки – заболевания, сопровождающегося болью и кровянистыми выделениями перед менструацией и после полового акта.

Криотерапия (обработка жидким азотом)

Глубина проникyовения достаточна только для лечения эктопии и кондилом. Более щадящий метод, почти не оставляет рубцов, безболезненный. Не применим при более глубоких или серьезных повреждениях.

Лазеротерапия

Имеется в виду хирургический лазер (т.е. лазерное удаление эрозии). Самый предпочтительный метод лечения. Одновременно удаляет ткань и останавливает кровотечение. Безболезненный, не оставляет рубцов, возможен даже у не рожавших, почти не дает осложнений, позволяет удалять повреждения под контролем микроскопа, на необходимую глубину.

Некоторые нюансы:

1. Не существует эрозии шейки матки – есть патология шейки матки. Для ее расшифровки нужно пройти обследование и только потом лечить. Любая патология шейки матки может быть началом опухолевого процесса и при длительном существовании превратиться в рак шейки матки.
2. Патология шейки матки может никак себя не проявлять. Если беспокоят выделения, особенно кровянистые, особенно усиливающиеся или появляющиеся после полового акта, — это сигнал для похода к врачу. Но если ничего не беспокоит, гинеколога необходимо посещать ежегодно, а лучше каждые полгода, и при каждом обращении проводить кольпоскопию и цитологическое исследование. Не нужно доводить болезнь до тяжелых стадий развития. Все лечится, если обнаружено рано.
3. При обнаружении патологии шейки матки сначала лечат воспаление. Это может привести к исчезновению эктопии, а главное – без этого нельзя правильно интерпретировать результаты цитологии и биопсии и делать операцию.
4. При подтвержденной патологии шейки матки ее удаляют независимо от возраста женщины и наличии родов в ее жизни. Современные методы лечения позволяют делать это без последствий для будущих родов. Удаление любым методом делают в начале менструального цикла, сразу после менструации, чтобы ранка успела зажить до начала следующей менструации.
5. Удаление патологии шейки матки – безболезненная процедура. Ощущения напоминают таковые в первый день менструации. Неприятно, но терпимо по сравнению с другими операциями.
6. Обследоваться и лечиться необходимо у квалифицированного специалиста по патологии шейки матки – гинеколога.

Радиоволновая эксцизия шейки матки

Лечение эрозии шейки матки может проводиться посредством радиоволновой эксцизии при помощи аппарата Сургитрон. Радиоволновая эксцизия шейки матки позволяет уберечь слизистые оболочки от послеоперационного формирования шрамов и рубцов, а также позволяет провести процедуру удаления эрозии максимально безболезненно.

Процесс радиоволновой эксцизии не затрагивает здоровые клетки, поэтому лечение эрозии данным способом рекомендуется нерожавшим женщинам. Из преимуществ данного метода тот факт, что отсутствует необходимость в длительном нахождении пациента в стационаре и не требует долгой подготовки операции.

• Наименование услуги

  Цена

• Биопсия шейки матки мультифокальная(без стоимости гистоанализа)

  4 000 pуб.

• Лазервапоризация эрозии, папилломы шейки матки

  12 000 pуб.

• Радиоволновая эксцизия шейки матки 1 категория сложности

  12 000 pуб.

• Радиоволновая эксцизия шейки матки 2 категория сложности

  15 000 pуб.

• Радиоволновая эксцизия шейки матки 3 категория сложности

  18 000 pуб.

• Радиоволновое вскрытие наботовых кист 1 шт

  500 pуб.

• Бужирование цервикального канала ( без стоимости анестезии)

  4 000 pуб.

• Местная анестезия

  1 500 pуб.

• В/в наркоз до 1 часа

  5 000 pуб.

• В/в наркоз до 30 минут

  4 000 pуб.

• Гистологическое исследование гинекологического диагностического материала (раздельное выскабливание, кольпоскопическая биопсия) (1-3 образца) (1 локал

  1 580 pуб.

Отзывы об услуге

«Эрозия шейки матки» и другие сомнительные женские диагнозы

Если во время беременности какие-то участки матки сокращаются, это нормально: матка — мышечный орган. Если при этом больно, но не сильно, то это тоже нормально на любом сроке. Если матка сокращается во время УЗИ — ничего страшного: это закономерная реакция мышечного органа на раздражение извне (датчиком). Но у нас часто бывает, что женщине по УЗИ ставят «гипертонус матки», страшно пугают выкидышем, назначают различные (не всегда безопасные) препараты и отправляют домой лежать. Это довольно безграмотно. Есть лишь несколько серьёзных состояний, при которых сокращение матки действительно опасно, и это оправдывает назначение лекарств со значительными побочными эффектами. «Отдельно стоит обратить внимание на то, что эти проблемы возникают во втором и третьем триместрах беременности, а не в первом, когда чаще всего ставят «гипертонус» по УЗИ в России», — говорит Татьяна Румянцева.

Если настоящий гипертонус матки сопровождается вагинальным кровотечением, болью, плохим сердечным ритмом плода и случается после 20-й недели беременности, это говорит об отслойке плаценты. Справиться с таким состоянием медикаментозно можно лишь в том случае, если мать и плод стабильны. При этом использовать токолитики (препараты, снижающие сократительную активность матки) следует только после 24-й недели и до 34-й. Делать это разрешается лишь в крайнем случае, так как препараты небезопасны. Обычно используется «Индометацин» или «Нифедипин». В России чаще применяют «Гинипрал» (гексопреналин), однако у этого средства довольно скромная доказательная база, да и, к примеру, в США оно не зарегистрировано. Магнезия имеет слабый эффект (если вообще имеет) и может применяться не больше 5—7 дней (по рекомендации Управления по контролю за продуктами питания и лекарствами США), так как при более длительном сроке использования бывает опасна.

Токолитики также назначают при преждевременных родах, чтобы задержать рождение ребёнка на несколько дней, пока вводятся кортикостероиды, которые способствуют созреванию лёгких. В этом случае должны быть не только сокращения матки, сопровождающиеся болью, но и раскрытие (больше 20 мм) или укорочение (меньше 25 мм) шейки матки.

Строгий постельный режим при гипертонусе и при «гипертонусе» ничем не поможет. Более того, это повышает риск образования тромбов и закупорки сосудов. Профилактически применять токолитики бессмысленно.

Болезненная любовь – «Hispareunia» после эрозии слинга у женщины-партнера

РЕЗЮМЕ

Введение

Эрозия / экструзия слинга – осложнение после установки субуретрального слинга при стрессовом недержании мочи у женщин, которое встречается примерно у 6% пациентов. Симптомы могут включать выделения из влагалища, инфекции, посткоитальное кровотечение и нарушение половой функции. Мало что известно о влиянии эрозии слинга на половую функцию партнера-мужчины.

Цель

Целью данного исследования было определить мужскую сексуальную функцию у партнеров женщин, перенесших установку слинга по поводу стрессового недержания мочи и у которых после операции развилась эрозия слинга.

Основные показатели результатов

Основными критериями конечных результатов были баллы по Краткой шкале мужской сексуальной функции (BMSFI) и визуальной аналоговой шкале (VAS).

Методы

Мужчины-партнеры пациентов, у которых возникла эрозия слинга по разным причинам, были адресованы и просили заполнить BMSFI и оценить сексуальную боль с помощью VAS до и через 6 месяцев после лечения эрозии слинга их партнеров-женщин.Участники дали информированное согласие, и те, кто перенес операцию на простате в течение последних 12 месяцев, были исключены. Для статистического анализа использовали SPSS версии 10.0 (SPSS Inc., Чикаго, Иллинойс, США).

Результаты

Тридцать два мужчины были включены в исследование и предоставили полный набор данных. Показатели по ВАШ как мера «гистареунии» улучшились с среднего балла 8 до среднего балла 1 после вмешательства. Некоторые области мужской сексуальной функции (сексуальный интерес, половое влечение, эякуляция и эрекция) были значительно улучшены, тогда как сила эрекции, проблемы с эякуляцией и проблемы с отсутствием интереса не изменились статистически значимо.

Выводы

Изменения мужской половой функции и, в частности, боли после введения перевязи у их партнеров-женщин могут быть вызваны воздействием перевязки. Это может отрицательно повлиять на сексуальный интерес и влечение. Диспареуния у мужчин – это жалоба, которую можно эффективно лечить, исправляя обнажение слинга. Мор С., Кун П., Мюллер, доктор медицины и Кун А. Болезненная любовь – «Hispareunia» после эрозии слинга партнерши.

Ключевые слова

Мужская диспареуния

Полипропиленовая праща

Эрозия пращи

Рекомендуемые статьиЦитирующие статьи (0)

Полный текст

Copyright © 2011 International Society for Sexual Medicine.Опубликовано Elsevier Inc. Все права защищены.

Рекомендуемые статьи

Цитирование статей

Проблемы религии и религиозной этики в JSTOR

Abstract

Поздняя современность стала свидетелем эрозии диморфной сексуальной парадигмы, которая, как в сильных, так и в слабых формах, характеризовала человеческую историю в том виде, в каком мы ее знаем. Недавние открытия в биологии и социальных науках в сочетании с измененными моделями сексуального поведения человека подняли новые важные вопросы о унаследованной парадигме.Религии Запада, чьи священные тексты, мифологии и кодексы поведения предполагают, что мужественность и женственность являются исключительными и взаимодополняющими типами сексуальности, каждый из которых определяет сексуальную идентичность, репродуктивную роль, социальную роль и пол партнера, – все чаще приходится бороться с теоретическими доказательствами и экспериментальными доказательствами полиморфной человеческой сексуальности. Унаследованные категории диморфной сексуальности не только оспариваются, но и становятся все менее понятными.

Информация о журнале

Журнал Американской академии религии обычно считается лучшим академическим журналом в области религиоведения.Этот международный ежеквартальный журнал в 68 томе и тиражом более 10 000 публикует лучшие научные статьи, охватывающие весь спектр мировых религиозных традиций, а также провокационные исследования методологий, с помощью которых эти традиции исследуются. В каждом выпуске также есть большой и ценный раздел рецензирования на книгу.

Информация об издателе

Oxford University Press – это отделение Оксфордского университета. Издание во всем мире способствует достижению цели университета в области исследований, стипендий и образования.OUP – крупнейшая в мире университетская пресса с самым широким глобальным присутствием. В настоящее время он издает более 6000 новых публикаций в год, имеет офисы примерно в пятидесяти странах и насчитывает более 5500 сотрудников по всему миру. Он стал известен миллионам людей благодаря разнообразной издательской программе, которая включает научные труды по всем академическим дисциплинам, библии, музыку, школьные и университетские учебники, книги по бизнесу, словари и справочники, а также академические журналы.

Prey: иммиграция, ислам и нарушение прав женщин (в твердом переплете)

28 долларов США.99

на наших полках; Обычно отправка в течение 1-2 дней

17 под рукой,
по состоянию на 13 марта 6:01

(ТЕКУЩИЕ ПРОБЛЕМЫ)

Описание

Почему так мало людей говорят о вспышке сексуального насилия и домогательств в городах Европы? Никто, находящийся у власти, не хочет признавать, что проблема связана с прибытием нескольких миллионов мигрантов – в основном молодых людей – из стран с мусульманским большинством.

В Prey , автор бестселлеров Infidel , Аяан Хирси Али, представляет поразительную статистику, уголовные дела и личные показания. Среди этих фактов: в 2014 году сексуальное насилие в Западной Европе резко возросло после периода стабильности. В 2018 году в Германии количество «преступлений против сексуального самоопределения» выросло на 36 процентов по сравнению с 2014 годом; почти две пятых подозреваемых не были немцами. В Австрии в 2017 году просители убежища подозревались в 11 процентах всех зарегистрированных случаев изнасилований и сексуальных домогательств, несмотря на то, что они составляли менее 1 процента от общей численности населения.

Это насилие не является плодом пропаганды альтернативных правых, настаивает Хирси Али, даже если неонацисты преувеличивают это. Это реальная проблема, которую Европа – и весь мир – не могут продолжать игнорировать. Она объясняет, почему так много молодых мужчин-мусульман, прибывающих в Европу, подвергаются сексуальным домогательствам и насилию, прослеживая корни сексуального насилия в мусульманском мире от узаконенной полигамии до отсутствия правовой и религиозной защиты женщин.

Сама беженка, Хирси Али не против иммиграции.В детстве в Сомали она перенесла калечащие операции на женских половых органах; будучи молодой девушкой из Саудовской Аравии, она остро осознала свою уязвимость. Она утверждает, что иммиграция требует интеграции и ассимиляции. Она хочет, чтобы европейцы реформировали свою сломанную систему, а американцы учились на европейских ошибках. Если этого не произойдет, призывы исключить новых мусульманских мигрантов из западных стран будут только усиливаться.

Глубоко исследованный и содержащий свежие и часто шокирующие открытия, Prey раскрывает кризис сексуального насилия и домогательств в Европе, который поворачивает часы в области прав женщин гораздо дальше, чем движение #MeToo продвигает его.

Об авторе

Аяан Хирси Али – активистка за права женщин из Сомали, защитник свободы слова и автор бестселлеров New York Times Infidel , The Caged Virgin , Nomad , Heretic и Вызов Давы . Она родилась в Могадишо, Сомали, выросла в Африке и на Ближнем Востоке, прежде чем искать убежища в Нидерландах, где впоследствии стала членом парламента.Сегодня она живет в США с мужем и двумя сыновьями.

Похвала за…

«[Аяан] Хирси Али предлагает убедительные доказательства своих неизбежных спорных заявлений в этом подробном и пугающем томе»
– Книжный список

« Prey разоблачает шокирующую волну сексуальных преступлений в якобы просвещенной Европе. Аяан Хирси Али защищает права женщин, выступая за новую модель интеграции для иммигрантов.Если отбросить политкорректность и общепринятые представления, « Prey » является своевременным напоминанием о том, что свобода – по сути, сама цивилизация – не является правом по рождению, но ее необходимо лелеять и защищать каждое поколение ».
– Сенатор Томас Коттон

«Опираясь на свои тяжелые удары в качестве сомалийского иммигранта и триумф в качестве европейского законодателя, Аяан Хирси Али сталкивается с самой трудноразрешимой проблемой многонациональной Европы: неспособностью защитить свою феминистскую культуру от мачизма ее преимущественно мусульманской иммигранты. Prey – лучшая книга по этому вопросу: широкая по культуре, скрупулезная в исследованиях, смелая и оригинальная в своих аргументах ».
– Кристофер Колдуэлл

«По всей Европе неправильная иммиграционная политика подрывает с трудом завоеванные права женщин. Обладая характерной грацией и ясностью, Аян Хирси Али документирует это тревожное событие и предлагает смелые, оригинальные и гуманные решения. Prey – это не обличение мультикультурализма, это руководство по его сохранению и обогащению.Эта блестящая и своевременная книга является обязательной к прочтению для всех, кому небезразлична судьба либеральной демократии ».
– Кристина Хофф Соммерс

« Prey предупреждает нас, что, если мы не переосмыслим нашу философию защиты женщин и детей, мы рискуем потерять одно из самых ценных активов западной цивилизации: верховенство закона».
– Генри А. Киссинджер

«В эпоху политики идентичности отсутствие воли к решению наших величайших культурных проблем не заставляет их исчезнуть.Он только усиливает самые крайние и нетерпимые голоса. В эпизоде ​​ Prey бесстрашный гражданский либертарианец Аяан Хирси Али призывает Запад противостоять безжалостной истине: создание возможности массовой исламской иммиграции при отсутствии воли к приучению мусульман к западным нормам и законам неизбежно подрывало права и подвергало опасности жизнь женщин, а не только мусульманки, все женщины. Смелая и блестящая книга ».
– Эндрю Маккарти

« Prey – это строгое и шокирующее разоблачение кризиса сексуального насилия, происходящего прямо в открытую, в, казалось бы, прогрессивной Европе.Чуткий и авторитетный, Аяан Хирси Али демонстрирует, почему мы не можем допустить, чтобы политкорректность и апатия преобладали над нашим долгом по защите прав женщин ».
– Мегин Келли

«И снова Аяан Хирси Али идет туда, куда другие не решаются. Здесь она криминалистически, тщательно и разрушительно разоблачает один из худших – и наиболее игнорируемых – скандалов нашего времени. Люди любого происхождения и всех политических убеждений в долгу перед ней за разоблачение скандала, который уже давно требует серьезного и глубокого отношения к нему.»
– Дуглас Мюррей

« Согласование прав женщин в западных странах с массовой иммиграцией остается деликатным вопросом. В книге Prey ведущий гуманитарный деятель Аяан Хирси Али конструктивно исследует эту тему, опираясь на обширные знания и данные, чтобы проиллюстрировать ключевые противоречия между культурным релятивизмом и правами женщин в двадцать первом веке. Она мужественно призывает всех нас – мужчин, женщин, тех, кто живет в западных странах и тех, кто живет в незападных странах, – твердо защищать универсальность прав человека и обеспечивать их постоянное соблюдение.
– Сенатор Бен Сассе

«В этой новаторской исследовательской работе Аяан Хирси Али документирует тревожную волну сексуального насилия в Европе. Жизненно важная и важная работа, Prey показывает, каким должен быть следующий шаг для #MeToo ».
– Марк Левин

IZA World of Labor – Мировые лидеры женского пола начинают кампанию, предупреждающую ущемление прав женщин

Мировые лидеры-женщины занимают единую позицию против ущемления прав женщин.Группа написала открытое письмо, в котором подчеркивается отсутствие прогресса в области прав женщин во всем мире и настоятельная необходимость борьбы с гендерным неравенством.

«Участие женщин в рабочей силе – важный фактор (и результат) роста и развития», – пишет Шер Верик. Подчеркивая важность качества работы женщин для достижения глобального развития, Верик добавляет, что «расширение доступа к среднему и высшему образованию особенно актуально».

Сусана Малькорра, министр иностранных дел Аргентины, утверждает, что существенным фактором, способствующим подрыву прав женщин, является то, как иногда воспринимают феминизм.Когда феминизм считается чем-то, что вредит мужчинам, он препятствует прогрессу гендерного равенства. «Есть ощущение, что авторитетная власть находится под угрозой со стороны женщин, завоевывающих уважение», – говорит она. Поэтому Малькорра утверждает, что существует острая необходимость в более четком понимании того, почему гендерное равенство необходимо и полезно для всех в обществе.

К Малькорре присоединились Хелен Кларк, бывший премьер-министр Новой Зеландии, и болгарский политик и бывший директор ЮНЕСКО Ирина Бокова в начале кампании.В открытом письме, написанном тремя женщинами, говорится: «Мы коллективно обращаем внимание на необходимость достижения полного гендерного равенства и расширения прав и возможностей женщин во всех сферах жизни общества». Они также подчеркивают необходимость «высвободить потенциал» женщин для достижения мира во всем мире.

Его подписали 26 женщин-лидеров, в том числе Сале-Ворк Зевде, президент Эфиопии, и бывший президент Ирландии Мэри Робинсон. Малькорра также утверждает, что в странах, которые испытали подъем «сильных мужчин-мачо», таких как Бразилия, Филиппины и Италия, наблюдается решительный отпор правам женщин.

«Это предложение, когда, например, если мужчины получают отпуск по уходу за ребенком, это не значит, что они что-то теряют, они выигрывают, неся ответственность за семью, они выигрывают от более тесных отношений с детьми, это не с нулевой суммой, это выигрыш. победить. Но ясно, что есть уголки власти в мире, которые не видят этого таким, – сказал Малькорра.

Прочтите статьи об участии женщин в рабочей силе.

Лечение эрозии полипропиленовой сетки после операции интравагинального мидуретрального слинга при стрессовом недержании мочи у женщин

Осложнения слинга мочевого пузыря | Боль, эрозия сетки и перфорация

Несколько стран запретили несколько трансвагинальных сеток, в том числе некоторые типы слингов, из-за осложнений. Женщины получают эти слинги для лечения стрессового недержания мочи или SUI. Но процедуры слинга сетки могут привести к таким проблемам, как перфорация мочевого пузыря, эрозия сетки во влагалище и болезненный половой акт.Женщины, у которых возникли осложнения, хотят, чтобы устройства были запрещены, а некоторые подали иски против производителей сеток.

«Мне было очень больно. Моя тазовая область загорелась », – написала Кристи Хаммонд, женщина, получившая перевязку от недержания мочи, в статье, опубликованной Drugwatch. «О сексе не могло быть и речи, потому что это было очень больно. У меня регулярно возникали инфекции мочевыводящих путей (ИМП) ».

«Мне было очень больно.Моя тазовая область загорелась. О сексе не могло быть и речи, потому что это было очень больно. У меня регулярно возникали инфекции мочевыводящих путей (ИМП) ».

Несмотря на эти осложнения, большинство врачей для лечения SUI предпочитают сетчатые стропы из пластика, называемого полипропиленом. Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов и врачи согласны с тем, что слинги для мочевого пузыря менее проблематичны, чем сетка для лечения пролапса тазовых органов.Фактически, FDA реклассифицировало хирургическую сетку для трансвагинального восстановления пролапса тазовых органов в качестве устройства высокого риска в январе 2016 года. А в апреле 2019 года агентство прекратило продажу всех сеток для восстановления POP в Соединенных Штатах.

Прекращение продаж FDA не влияет на сетку для SUI. Женщины, которым навязывают повязки для мочевого пузыря, утверждают, что полипропилен имеет одинаковые риски независимо от того, куда врачи помещают продукт.

Частота осложнений, связанных с перевязкой мочевого пузыря, может варьироваться в зависимости от того, какое исследование вы читаете.Это затрудняет точное представление о том, насколько безопасны эти устройства. Основываясь на изученных исследованиях, FDA считает, что сетчатые стропы для SUI в целом безопасны и эффективны.

«Согласно отчетам женщин и медицинским осмотрам, операции с использованием сетки при SUI были успешными примерно у 70-80 процентов женщин в течение одного года», – говорится в сообщении FDA на своей странице слинга мочевого пузыря.

Но агентство не нашло преимуществ в использовании сетчатых строп.

«Об аналогичных результатах эффективности сообщается после хирургических вмешательств без использования сетки», – говорится в сообщении агентства.

Информация о судебном иске

Более 108 000 исков утверждали, что трансвагинальная сетка вызывает осложнения, включая боль, кровотечение, инфекцию, перфорацию органов и аутоиммунные проблемы.

Посмотреть судебные иски

Незначительные и долгосрочные осложнения

Сетчатые слинги имеют более высокий уровень осложнений, чем слинги из естественных тканей.Например, синтетическая сетка может вызвать инфекцию, длительную боль и эрозию сетки – осложнение, при котором сетка разрушает окружающие ткани. По данным Американского колледжа акушерства и гинекологов, ни один из этих рисков отсутствует при использовании тканевых строп.

По словам производителя сеток Boston Scientific, возможные осложнения хирургического вмешательства с использованием сетки включают:

• Местное раздражение в области раны
• Инфекция
• Обструкция мочевыводящих путей и задержка мочи
• Вагинальный экструзия
• Эрозия через уретру

,00

• Рубцы
• Рубцовая контрактура
• Воспаление
• Формирование свищей
• Миграция аппарата
• Боль
• Рецидив недержания мочи
• Повреждение нерва
• Отечность и покраснение в области раны
• Выделения из влагалища
• Усталость
• Одышка
• Кровотечение

Незначительные осложнения, такие как кровотечение, кратковременная задержка мочи и кратковременная боль после операции, обычно легче устраняются.Долгосрочные осложнения, такие как экструзия влагалища, эрозия, перфорация органов и рецидивирующие инфекции, могут быть более трудными для лечения.

Женщинам с длительными осложнениями может потребоваться повторная операция, которая может оказаться сложной. Инфекции, такие как сепсис, могут быть опасными для жизни. Некоторые из этих проблем могут возникнуть из-за хирургической техники.

Экструзия и эрозия влагалища

Одной из основных проблем со стропами мочевого пузыря было выдавливание или эрозия сетки.Экструзия и эрозия относятся к проникновению сетки во влагалище, мочевой пузырь, уретру или другой орган. В этих случаях сетка изнашивается сквозь ткани.

Согласно статье доктора Кристиано Мендеса Гомеса и его коллег, степень вагинальной экструзии варьируется от 0% до 1,5% для позадилонных петель, которые вводятся через разрез во влагалище и располагаются в U-образной форме вокруг уретры. Концы позадилонных петель проводят между мочевым пузырем и лобковой костью и выводят через надрезы над лобковой костью.

Согласно статье, опубликованной во Внутреннем бразильском журнале урологии, для трансобтураторных строп скорость вагинальной экструзии варьируется от 0 до 10,9 процента. Эта процедура, известная как ТОТ, исключает пространство между лобковой костью и мочевым пузырем. Сетка вводится через влагалище, а концы выводятся через разрезы между половыми губами и складками бедер.

Кроме того, Гомес и его коллеги обнаружили, что эрозия уретры произошла после менее чем 1 процента операций слингом.

РАСШИРЯТЬ

Сетчатые стропы поддерживают уретру для лечения СНМ, но сетка может разрушаться во влагалище, мочевом пузыре или других органах.

Доктор Чарльз Рардин, уролог из Провиденса, Род-Айленд, написал в Ob.Gyn. Новости о том, что данные долгосрочного наблюдения указывают на то, что эрозия происходит после 3–4 процентов перевязок, в отличие от 1 процента, как первоначально предполагалось.

Некоторые исследования предполагают, что риск эрозии может быть связан с хирургической техникой. Но сетка, которая больше контактирует со стенкой влагалища, такая как трансобтураторная повязка, может иметь более высокий уровень эрозии влагалища.

«Многие из зарегистрированных случаев эрозии происходят через несколько лет или дольше после операции», – написал Рардин. «Трудно обвинить хирургическую технику в такой отсроченной эрозии».

Знайте о рисках

Сетчатые стропы могут привести к заражению и инфицированию вскоре после операции или спустя много лет.Это может привести к сложной операции по удалению сетки, которая может вызвать дополнительные осложнения и не может полностью устранить хроническую боль или другие побочные эффекты.

Женщины, страдающие этим осложнением, могут испытывать боль во время полового акта, недержание мочи, позывы к мочеиспусканию, инфекции мочевыводящих путей или непроходимость.

У некоторых женщин симптомы могут не проявляться, пока проблема не станет более серьезной. Это делает более важным, чтобы женщины, перенесшие операцию по перевязке мочевого пузыря, регулярно обращались к врачу.Иногда эрозия возникает через несколько недель после операции.

Пример применения экструзии

В тематических исследованиях, опубликованных в журнале Urology, доктор Эндрю Л. Сигел описывает 48-летнюю женщину, перенесшую операцию слинга ObTape. Она жаловалась на стойкие желтые выделения из влагалища, а ее муж жаловался на боли во время полового акта.

Признаки экструзии

Одна женщина перенесла экструзию влагалища через три месяца после операции слинга.Ее муж сказал, что во время полового акта он чувствовал «зубы во влагалище».

«Через три месяца после операции она заявила, что ее муж почувствовал« зубы »во влагалище во время полового акта», – написал Сигел.

При обследовании органов малого таза выявлено выдавливание сетки.

В некоторых случаях возможно консервативное лечение эрозии. Например, некоторые хирурги могут прописать крем с эстрогеном для местного применения, чтобы помочь заживлению тканей влагалища.

Но у женщины возникло периодическое недержание мочи, и ей потребовалось удалить всю повязку и установить новую повязку.

Перфорация мочевого пузыря и кишечника

Перфорация мочевого пузыря и кишечника после установки сетки может привести к серьезным инфекциям и другим проблемам. Перфорация возникает, когда сетка или хирургические инструменты травмируют или разрезают орган.

Перфорация мочевого пузыря является наиболее частой из этих проблем.Это происходит, когда хирурги протыкают мочевой пузырь иглой при установке сетки. Но это также может произойти, когда края сетки разрезают мочевой пузырь. Джон Чанг и Доминик Ли из отделения урологии больницы Св. Георгия в Австралии сообщили о частоте перфорации мочевого пузыря до 24 процентов.

Факторы риска повреждения кишечника

Согласно исследованиям, у пожилых и худых женщин, перенесших операцию на органах малого таза, был более высокий риск перфорации кишечника.

По словам Рардина, в большинстве случаев перфорация мочевого пузыря не приводит к длительным травмам. Перфорация обычно возникает из-за хирургической техники. Хирурги могут исправить это, если быстро диагностируют травму. В некоторых случаях пациентам может потребоваться катетер для мочеиспускания, пока травма заживает.

Перфорация кишечника – гораздо более серьезные травмы, и, к счастью, они встречаются редко. Эти травмы опасны, потому что бактерии могут вытекать из кишечника и вызывать опасные для жизни инфекции.Примерно до 2008 года FDA получило сообщения как минимум о девяти перфорациях кишечника. По словам Чанга и Ли, шесть из них закончились смертью.

Пример использования перфорации

В отчете о клиническом случае, опубликованном в 2015 году в журнале «Отчеты о случаях акушерства и гинекологии», авторы Питер Каскак и Бранислав Копкан поделились историей 66-летней женщины, у которой сетка пронзила ее тонкую кишку после операции слинга. Ей была сделана операция у опытного специалиста по установке перевязки, и не сообщалось об осложнениях во время операции.

Изначально у нее не было ни лихорадки, ни других симптомов инфекции. Однако на следующий день после операции она жаловалась на тошноту и рвоту. КТ показала воспаление брюшной стенки, врачи провели диагностическую операцию. Они обнаружили, что сетчатая повязка пробила ее кишечник, а содержимое кишечника просочилось в брюшную полость. У нее случился септический шок, и она умерла через три дня после перевязки.

«Хотя установка мидуретрального слинга является минимально инвазивной операцией, хорошие диагностические навыки, правильная оценка показаний, безопасное выполнение процедуры и тщательный послеоперационный мониторинг имеют первостепенное значение для безопасного и эффективного результата операции», – пишут авторы.

Kascak и Kopcan сообщили, что травмы кишечника во время установки повязки были редкими, и сказали, что к 2004 году осложнение произошло примерно у 35 из 700 000 женщин. Семеро из этих пациентов умерли. Врачи не знали причины до смерти в пяти из этих случаев.

Информация о судебном иске

Женщины, которым установили трансвагинальный сетчатый имплант для лечения пролапса тазовых органов или стрессового недержания мочи, подают иски после перенесенных болезненных травм.

Посмотреть судебные иски

Частота осложнений

Фактическая частота осложнений, связанных с перевязкой сетки, сильно различается в зависимости от исследования, и несколько факторов могут повлиять на частоту сообщений.

В одном исследовании, опубликованном в Nature в 2017 году, Ким Келти и его коллеги наблюдали за 92 246 женщинами, которым от недержания были имплантированы трансвагинальные сетчатые слинги.Исследование показало, что частота осложнений в течение 30 дней или пяти лет после установки сетки составила около 9,8%.

По словам Рардина, наиболее частыми осложнениями после слинга являются перфорация мочевого пузыря, дисфункция мочеиспускания, эрозия сетки и послеоперационная боль.

«Часто осложнения могут быть значительно более серьезными, чем исходное недержание мочи», – пишет Рардин. «Важно серьезно отнестись к осложнениям при установке стропы. Сообщите пациентам, что их симптомы имеют значение и что есть способы справиться с осложнениями.”

«Часто осложнения могут быть значительно более серьезными, чем исходное недержание мочи. Важно серьезно отнестись к осложнениям при установке стропы ».

Одна из сложных проблем, связанных с осложнениями слинга мочевого пузыря, заключается в том, что фактическая частота осложнений, о которых сообщают, не соответствует действительности.Низкая частота осложнений может дать женщинам ложное чувство безопасности, в то время как более высокая частота осложнений у менее опытных хирургов может напугать женщин.

Доктор Элизабетта Костантини и его коллеги опубликовали обзор в журнале Европейской ассоциации урологов, который обнаружил, что большинство осложнений может быть занижено. Они предложили несколько объяснений редкости серьезных осложнений в отчетах: отчеты могут занижать степень сложности; хирурги, у которых частота осложнений выше, не отвечают на анкеты; хирурги малого и большого объема испытывают различия; а хирурги, которые лечат осложнения, могут учитывать занижение и завышение показателей осложнений.

Кроме того, по словам Костантини и его коллег, диагностировать и лечить серьезные и второстепенные осложнения сложно даже опытным хирургам. Эти проблемы могут возникнуть во время или после операции. Частота осложнений также зависит от техники и слинга, который в некоторых случаях используется.

Осложнения во время или вскоре после операции

Интраоперационные или периоперационные осложнения возникают во время операции или вскоре после нее. В общем, это реже. По словам Костантини и его коллег, частота осложнений колеблется от менее 1 процента до 14 процентов.Серьезные осложнения, такие как повреждения сосудов и нервов, а также поражения кишечника, наблюдались менее чем у 1 процента женщин. Легкие травмы мочевого пузыря составляли от 0,5 до 14 процентов. Значительная кровопотеря произошла примерно у 2,7–3,3 процента женщин.

Послеоперационные осложнения

Большинство проблем, с которыми женщины сталкиваются со стропами мочевого пузыря, возникают после операции. Иногда они могут возникнуть через несколько лет. Гомес и его коллеги сообщили о некоторых из самых последних показателей послеоперационных осложнений, собранных в результате нескольких исследований позадилонных и трансобтураторных слингов.Почечно-лобковые слинги имеют более высокий уровень осложнений в целом – от 4,3 до 75 процентов.

Средняя частота осложнений послеоперационной перевязки сетки в 2017 г.

Травма кишечника

Частота осложнений в зависимости от типа строп

Перед операцией по перевязке мочевого пузыря женщины должны спросить своих врачей о методике, которую они планируют использовать.Частота осложнений может варьироваться в зависимости от типа сетчатого слинга и техники.

В исследовании Z. Chen и его коллег, проведенном в 2010 году, посвященном слингу мочевого пузыря, опубликованном в Urologia, были проанализированы результаты 187 женщин, получивших слинги для мочевого пузыря для лечения стрессового недержания мочи. Авторы обнаружили, что трансобтураторная вагинальная лента наизнанку (TVT-O) и трансобтураторная вагинальная лента снаружи внутрь (ТОТ) являются более простыми методами с меньшими осложнениями по сравнению с вагинальной лентой без натяжения (TVT).

Женщины, которые использовали TVT, в среднем находились в больнице пять дней по сравнению с двумя днями в группе TOT.

Частота осложнений в исследовании составила:

• 15,6% для вагинальной ленты без натяжения (TVT)
• 9,20 процента для трансобтуратора вагинальной ленты наизнанку (TVT-O)
• 8,90% для трансобтураторной вагинальной ленты снаружи внутрь (ТОТ)

Осложнения процедур включали дискомфорт при мочеиспускании, кровотечение за пределами кровеносных сосудов и дисфункцию нижних конечностей. TVT была единственной процедурой, связанной с перфорацией мочевого пузыря.Несмотря на частоту осложнений, врачи сочли стропы безопасными.

«Три метода подвешивания уретры без натяжения имеют одинаковую эффективность, все они являются безопасными и эффективными процедурами для лечения СНМ у женщин», – пишут авторы.

Смежная эрозия неактивного X в плюрипотентности человека завершается глобальным гипометилированием ДНК

РЕЗЮМЕ

Плюрипотентные стволовые клетки человека (hPSC) женского пола склонны к эрозии X-хромосомы (XCE), прогрессирующей утрате ключевых эпигенетических свойств неактивных X который инициируется репрессией XIST , длинной некодирующей РНК, необходимой для инактивации X.В результате, ранее заглушенные гены на разрушающемся X (Xe) повторно активируются, некоторые из которых, как считается, обеспечивают селективные преимущества. На сегодняшний день спорадический и прогрессивный характер XCE в значительной степени заслонил его масштаб, динамику и ключевые переходные события.

Чтобы восполнить этот пробел в знаниях, мы выполнили комплексный анализ метилирования ДНК (DNAme), доступности хроматина и экспрессии генов в сотнях образцов hPSC. Дифференциальное метилирование по Xe позволяет упорядочивать женские hPSC по траектории XCE от инициации до терминальных стадий.Наши результаты идентифицируют критический цис -регуляторный элемент для экспрессии XIST , прослеживают непрерывно растущие домены реактивации до нескольких эухроматических источников на Xi и указывают, что поздняя стадия Xe нарушает ДНК-мах во всем геноме. Удивительно, но из этого измененного эпигенетического ландшафта возникают избранные черты наивной плюрипотентности, предполагая, что ее связь с дозировкой Х-хромосомы может частично сохраняться в эмбриональном развитии человека.

ВВЕДЕНИЕ

Плюрипотентные стволовые клетки человека (hPSC) эмбрионального (ESC) или индуцированного (iPSC) происхождения напоминают внутреннюю клеточную массу (ICM) раннего постимплантационного эмбриона.Способные дифференцироваться во все три зародышевых листка, hPSC стали краеугольным камнем для моделирования человеческого заболевания in vitro ¹ и имеют огромный потенциал для будущих методов лечения аллогенных или аутологичных клеток ² . Однако в дополнение к ранее отмеченным проблемам с их генетической ^3–6 и эпигенетической ^7–9 стабильности, можно ожидать, что женские hPSC, в частности, будут отставать от мужских hPSC в некоторых приложениях из-за прогрессирующей реактивации их неактивных X (Xi), процесс, называемый эрозией Х-хромосомы (XCE) ^10–12 .

В отличие от женских hPSC, которые отражают состояние поздних эпибластных (или «примированных») клеток после полной инактивации X-хромосомы (XCI), женские ESC и iPSC мыши приблизительно соответствуют ICM («наивного») доимплантационного эмбриона. , и несут две активные хромосомы X (Xa) ¹³ . Чтобы перейти от наивной плюрипотентности к праймированной и дифференцироваться, мышиные ESCs д. Молчать все лишние X хромосомы, чтобы поддерживать только один Xa на диплоидный геном ^14–16 . Это обязательное сочетание состояния плюрипотентности с дозировкой X продвинуло большую часть нашего современного понимания случайной инактивации X хромосомы (XCI) ^17,18 .Тем не менее, недавние исследования периимплантационных эмбрионов у ряда млекопитающих пролили свет на важные видоспецифичные различия в становлении XCI ^19–23 .

XCE в женских hPSC – это in vitro, и видоспецифический дефект в поддержании XCI, который лучше всего понимать как два механистически различных наблюдения. Во-первых, клетки эпибласта, происходящие из ESC мыши, после XCI точно поддерживают экспрессию Xist и подавление генов Xi ²³ , тогда как примированные hPSC самки обнаруживают сильную тенденцию к потере экспрессии XIST ^24,25 .Во-вторых, даже после делеции Xist подавляющее большинство генов Xi мыши остаются стабильно замалчиваемыми из-за длительного и самораспространяющегося метилирования ДНК (DNAme) промоторов и CpG-островков ^26–28 , с редкими и контекстно-специфическими исключения ^29–31 . Более того, даже короткий период (<3 дней) экспрессии мыши Xist достаточен, чтобы необратимо замолчать гены на долгое время ³² . Напротив, женские hPSCs, которые потеряли экспрессию XIST , как было продемонстрировано, подвергаются частой, прогрессирующей и необратимой X-реактивации ^10,33–37 .

Тем не менее, несмотря на актуальность hPSCs для моделирования Х-сцепленных заболеваний и будущих терапий замещения клеток, наше понимание механизмов XCE остается ограниченным, и большинство исследований ограничено небольшим количеством линий. В результате описания XCE варьировались от второстепенного ²⁴ , основного ³⁸ до полной реактивации Xi ¹⁰ , что указывает на то, что прогрессивный характер этого явления может потребовать анализа по большему количеству женских линий hPSC. Дополнительные наблюдения из анализов экспрессии генов, сравнивающих ESC vs.Линии ИПСК ³⁹ или предпочтительная реактивация Х-связанных онкогенов ³⁶ не были отражены в более крупных анализах ДНКм ^10,38 .

Чтобы восполнить этот пробел в знаниях, мы выполнили комплексный анализ имеющихся данных ДНКме, доступности хроматина и экспрессии генов по 399 линиям hPSC. Дифференциальная ДНКме по разрушающемуся X (Xe) упорядочивает женские hPSCs по траектории XCE от инициации до конечных стадий. Мы обнаружили, что XCE распространяется непрерывным образом из нескольких эухроматических регионов, которые избегают XCI, и наблюдаем, что терминальный XCE приводит к специфическому для женщин гипометилированию ДНК, которое запускает некоторые маркеры наивной плюрипотентности.Наш анализ важен для понимания и постановки эпигенетической верности моделей женского hPSC, а также для выявления влияния дозировки Х-хромосомы на плюрипотентность, специфичную для эмбриональных стадий.

РЕЗУЛЬТАТЫ

Образцы женских hPSC прослеживают общий путь через XCE

Чтобы составить исчерпывающее представление о динамике метилирования Х-хромосомы при плюрипотентности человека, мы сопоставили данные Illumina BeadChip (450K, MethylEpic) из всех подходящих исследований hPSC в GEO ^{38, 40–46} .После удаления линий hPSC с неверно перечисленными половыми хромосомами (см. Методы) полученный суперпродукт охватывал 471 линию hPSC (рис. S1A). Поскольку X-сцепленная ДНКме (β-значения) в женских hPSCs усредняются между Xi и Xa, зонды в генах, подверженных XCI, сосредотачиваются вокруг значения β, равного 0,5 (Fig. 1A). Линии мужских hPSC группируются вместе в PCA (Fig. 1B), где PC1 отражает большой диапазон средней ДНК-хромосомы X женских hPSCs (Fig. S1B-E). На любом ПК не было практически никакого влияния со стороны исходного исследования, категории hESC / iPSC или идентификатора hPSC, за исключением чрезмерно представленного кластера преобладающей модели hESC H9, которая искажала общий анализ и была удалена (см. Методы).Этот сбалансированный расширенный набор из 178 мужских и 221 оставшихся женских линий hPSC выявил избыточную специфичную для женщин дисперсию в X-сцепленных зондах без общей половой дифференциации по аутосомным зондам (рис. 1C, D). Это подтверждает, что XCE не может быть результатом полногеномных различий ДНКм между полами ³⁸ , и позволяет идентифицировать XCE-релевантные зонды на основе их значительной избыточной дисперсии у женщин по сравнению с мужскими hPSC (рис. S1F, G). Действительно, существенно различающиеся зонды (p ≤ 0,01, тест Брауна-Форсайта) на X имеют бимодальное распределение, которое отражает гены, подверженные XCI (с центром вокруг 0.5), и, вероятно, гены беглецов, которые гипометилированы как на Xa, так и на Xi, с широким диапазоном зондов между этими двумя пиками (Fig. S1H). Среднее значение X DNAme в женских hPSCs почти идеально коррелирует с зондами, зависящими от пола, превышая свои корреляции с невариантными X-связанными зондами или уровнями ДНКме по всему геному (Fig. S1I, J).

Рисунок 1: XCE отражается в высокой X-специфической дисперсии женских hPSC.

(A) Распределение ß-значений зондов на X в женских (красный) и мужских (синий) образцах.

(B) Анализ главных компонентов (PCA) женских (красный) и мужских (синий) образцов с использованием только X-связанных зондов.

(C) и (D) Графики плотности ß-дисперсии зонда на X и аутосомах, соответственно, с красными линиями для женских образцов и синими линиями для мужских образцов (Колмогоров-Смирнов, указано расстояние KS, с p-значениями KS 5,6 e-15 и 0,78 для C и D соответственно).

(E) PCA женских выборок, окрашенных их кластером k-средних (см. Методы).

(F) Тепловая карта ДНКме высокодисперсных X-зондов в женских hPSC. Образцы в каждом кластере k-средних (A-F) упорядочены по среднему значению X DNAme.Зонды (строки) сгруппированы по переходу (наименьшее значение q ≤ 0,05) и изменению значения β (↑ вверх, вниз ↓ или колебания независимо от перехода ~). Кластерные переходы пронумерованы (1-5).

Для постановки прогрессии XCE мы использовали пробы с высокой половой дисперсией для выполнения кластеризации выборок самок с помощью K-средних, что дало шесть кластеров (рис. 1E, рис. S1K), упорядоченных по их среднему X DNAme. Затем мы идентифицировали все дифференциально метилированные зонды (DMP) между соседними кластерами (Fig. 1F). Несмотря на включение как ИПСК, так и ЭСК из восьми независимых исследований, DNAme очень похож для любого данного зонда в каждом кластере, демонстрируя, что большинство событий реактивации не являются спорадическими.Более того, из девяти линий hPSC, вносящих вклад в более чем один кластер, у восьми выявленное число пассажей увеличивается в соответствии с этим порядком кластеров, предполагая, что они отражают общую временную шкалу XCE. В целом, мы видим четкий систематический паттерн изменений DNAme (Fig. 1F), который иллюстрирует пошаговое прогрессирование XCE. Зонды, теряющие ДНКме, намного превосходят количество зондов, приобретающих ДНКме, при этом связанные с промоторами зонды преобладают среди деметилированных DMP (Рис. S2A). Из 450 X-сцепленных генов, которые подвержены XCI (промотор-связанный β между 0.3-0,7 в кластере A), только семь (1,6%) сохраняют свою ДНКме в кластере F, предполагая, что реактивация гена через Xe практически завершена.

XIST и тандемный повтор FIRRE подвергаются гиперметилированию в начале XCE

С этой прогрессивной стадией XCE в руке мы проанализировали пошаговые изменения ДНКме, происходящие при каждом переходе между кластерами A-F. Анализ перехода 1 (кластер от A к B) показывает, что DMP находятся в определенных регионах (рис. 2A, синяя линия) в шаблоне, который не соответствует ни общей плотности зонда (серый, 9191 зонда), ни 1412 зондам, которые не прошли DMP. порог (q> 0.05, черная линия, рис. S2B). Плотность DMP уменьшающейся ДНКме обычно совпадает с плотностью DMP с увеличивающейся ДНКме, что свидетельствует о реактивации регионального гена Xi, с более низкой и более высокой ДНКme ассоциированных с промотором по сравнению с транскрибируемыми внутригенными CpG, соответственно.

Рисунок 2: Дифференциальный анализ ДНКме на Xe отличает ранний от позднего XCE

(A) График плотности зондов по координатам X показывает зонды перехода 1 (1 ↓ ↑, синий) для концентрации независимо от общей плотности зонда (заштрихованная область серого цвета) в контраст с колеблющимися зондами (~, черный).К.С. расстояния определяют схожесть с частотным распределением распределения плотности нулевого зонда (* K.S. значение p = 5,09e-11 для зондов с синим переходом 1).

(B) График вулкана дифференциально метилированных зондов (DMP) перехода 1, окрашенный координатой X (легенда над графиком). Верхние увеличивающиеся DMP с аннотациями по названию гена.

(C) ДНКme зондов XIST и FIRRE в кластерах A-F. Линии (F) и (G) указывают положение зондов по отношению к генам и их аннотированным областям (* указывает DMP из B).

(D) и (E) XIST и FIRRE экспрессия (VST + пакетная коррекция / log2-преобразованная), соответственно, для всех образцов с доступными данными РНК-seq (все, кроме кластера E).

(F) и (G) Покрытие ATAC-seq для XIST и FIRRE соответственно. Горизонтальные линии под покрытием обозначают так называемые пики (серый, черный), включая дифференциал, замыкающие пики (красный). Нижние панели (F) и

(G) соотносят DMP и ATAC-пики с цис- регуляторными сайтами для XIST и FIRRE , соответственно.

Для перехода 1 восемь DMPs выделяются по степени и значимости увеличения DNAme (Fig. 2B, C), с пятью DMP в XIST и тремя в тандемном повторе FIRRE . Утрата экспрессии XIST была предложена как раннее или причинное событие для XCE ^{10,24,25,37,47} , но ее механистическая основа остается неясной. Из 9 зондов, охватывающих XIST , пять изменяют переход 1, два из которых расположены в его коровом промоторе ⁴⁸ .Остальные три DMP расположены в вероятном энхансере в экзоне 1 (~ 1,2 т.п.н. от промотора XIST ), два из которых непосредственно перекрывают сайты связывания для фактора транскрипции YY1 (рис. 2C, F). Родственный мотив YY1 является консервативным для ряда гомологов XIST млекопитающих, и YY1 необходим для экспрессии Xist в ESCs ⁴⁹ мыши. Связывание YY1 чувствительно к DNAme ⁵⁰ , и в дифференцированных клетках только молчащий аллель XIST на Xa имеет метилированные родственные мотивы YY1 ⁵¹ .В самом деле, поскольку те же самые сайты YY1 приобретают DNAme в переходе 1, основной перекрывающийся пик ATAC теряется и экспрессия XIST падает более чем на два порядка величины (Fig. 2F, D).

Три других DMP высшего ранга, увеличивающиеся в карте DNAme до локуса FIRRE , который также является единственным X-сцепленным геном за пределами XIST , который теряет пики ATAC при переходе 1 (рис. 2C, G). Этот эволюционно консервативный тандемный повтор образует длинные CTCF-опосредованные петли хроматина с двумя другими тандемными повторами DXZ4 и ICCE на Xi и транскрибирует длинную некодирующую РНК (нкРНК) в основном из Xa ^52,53 .Три DMP FIRRE , получающие ДНК-me, находятся внутри тандемного повтора, характеризующегося закрытием («локальный повтор») пиков ATAC, в то время как зонды рядом с его основным промотором уменьшаются в DNAme (рис. 2C, G). Это согласуется с реактивацией гена, хотя умеренное увеличение экспрессии FIRRE не было статистически значимым (рис. 2E) и может отражать только частичный уход от XCI или состояние хроматина, подобного ускользнувшему, как это видно для мыши Firre ^{54, 55} . Соответствующее увеличение и потеря ДНКме и доступность хроматина тандемных повторяющихся элементов внутри FIRRE отражают изменения на XIST в переходе 1, и позволяют предположить, что этот консервативный ген нкРНК является одним из самых первых, отражающих XCE.

Непрерывное развитие XCE происходит около генов беглецов

В то время как XIST -соседство, по-видимому, оставалось невосприимчивым к ранней потере ДНКme (рис. 2A), гены около FIRRE ( 130 Mb, пурпурный), XACT и DXZ4 (110-115 Mb, синий / бледно-лиловый) на длинной руке X и на короткой руке, богатой беглецами, испытали самую раннюю и наиболее значительную потерю DNAme в XCE. Отслеживая характерные для перехода значимые DMP (рис. 3A, цвета) и кумулятивные изменения ДНК (серый), мы обнаруживаем, что XCE, по-видимому, исходит из этих конкретных хромосомных областей, а затем распространяется непрерывным образом по остальной части X-хромосомы во время последующих переходов. (Рис.3А). Эта волна потери DNAme отражается прогрессивным (~ 2-кратным) увеличением доступности хроматина в тех же регионах (Fig. 3B & inset). Любопытно, что DMP и открывающиеся пики ATAC, специфичные для ранних переходов, находятся в богатых h4K27me3 областях Xi, которые, вероятно, наиболее чувствительны к потере РНК XIST , тогда как пики более поздних переходов имеют тенденцию попадать в богатые h4K9me3 области. Такая ассоциация со специфическими компартментами хроматина лучше всего отражается в прогрессивном сдвиге DMP и дифференциальной пиковой плотности ATAC, коррелирующей с уровнями h4K27me3 до h4K9me3 на поздней стадии XCE (рис.3В, Е). В общем, эти паттерны доступности ДНКм и хроматина убедительно указывают на то, что XCE диктуется линейным распространением реактивации по хромосоме.

Рисунок 3: Непрерывное распространение XCE от эухроматического происхождения на карте Xi

(A) кумулятивных (серый) и специфичных для перехода DMP (цвета) изменений β-значений по X, нанесенных под специфическим для Xi h4K27me3 (темно-бирюзовый) и h4K9me3 (коричневый) H9 ChIP-seq из ³⁷ . Серые вертикальные линии указывают местоположения беглецов, определенные по ДНКм в кластере A, как в ⁵⁷ .

(B) Карта покрытия дифференциальных пиков ATAC через X. Отрицательное покрытие указывает на отрицательное кратное изменение. Переходы 4 и 5 объединены (фиолетовый) из-за отсутствия данных ATAC-seq для кластера E. Гистограммы log2FC дифференциальных пиков для каждого перехода вставлены вверху справа (вставка).

(C) Пирсоновские корреляции переходных изменений DMP (окрашены в A) на уровни h4K27me3 (темно-бирюзовый) и h4K9me3 (коричневый).

(D) и (E) Распределение расстояний DMP относительно местоположений убегающих для каждого перехода на коротком плече и длинном плече, соответственно, с черными вертикальными линиями, обозначающими среднее расстояние.Распределения нулевых расстояний с использованием переставленных беглецов (широкий серый цвет) или переставленных DMP (узкий серый цвет), нанесенные на график под фактическими распределениями. Вычисленные p-значения (двусторонний ранговый тест против переставленных распределений), указанные вверху слева (переставленные беглецы) и вверху справа (переставленные DMP) каждого графика.

(F) Пирсоновские корреляции переходных пиков ATAC (B) с уровнями h4K27me3 (темно-бирюзовый) и h4K9me3 (коричневый).

(G) и (H) Распределение расстояний пиков ATAC относительно местоположений убегающих для каждого перехода на коротком плече и длинном плече, соответственно, с черными вертикальными линиями, обозначающими среднее расстояние.

Прослеживая такой непрерывный XCE до его истоков, мы заметили, что ранние DMP и открывающиеся пики ATAC отображаются рядом с генами, которые, как известно, избегают XCI, как на коротком плече, богатом беглецами, так и на длинном плече из двух регионов в частности (рис. 3A, B): 1.) фокальный домен размером ~ 5 Мбайт с центром на FIRRE и 2.) домен шириной ~ I5 Мбайт слева от макросателлита DXZ4 (около PLS3-AS1 ), Ранее было показано, что требуется DXZ4 для обслуживания h4K27me3 ⁵⁶ .Чтобы подтвердить и количественно охарактеризовать эту закономерность, мы сначала идентифицировали настоящих гена беглеца в линиях hPSC кластера A, используя подход Cotton, et al. ⁵⁷ . В общей сложности мы идентифицировали 15 генов, которые, основываясь на DNAme, вероятно, избегают XCI в не кодирующих, XIST -положительных hPSC (фиг., S2E-G). В отличие от генов, подверженных XCI, эти гены имеют в основном гипометилированные промоторы и гиперметилированные генные тела из-за их биаллельной экспрессии (рис.S2H). Кроме того, псевдо-аутосомная область 1 (PAR1) не представлена ​​на чипах Illumina, но, как известно, ускользает от XCI. Поэтому мы проверили, достигает ли минимальное линейное расстояние от беглецов с короткой рукой / PAR1 или с длинной рукой, сегрегированных DMP или дифференциальных пиков ATAC при их переходе (рис. S2I-N). Действительно, эти кумулятивные распределения предполагают, что XCE проходит между ~ 3-9 Мб для большинства переходов со средним расстоянием выхода ~ 15 Мб (DNAme) и ~ 10 Мб (ATAC) в средней точке XCE в переходе 3, достигая Хроматин h4K9me3 последним в переходах 4 и 5 (рис.3A-C, F).

Чтобы определить значимость этого наблюдения, мы выполнили два теста на перестановку для каждого перехода. В первом мы рандомизировали 15 меток беглецов по всем генам, представленным зондами, а во втором тесте мы рандомизировали метки перехода для каждого пика DMP / ATAC. Результирующие распределения этих перестановок представлены как широкие (рандомизированные беглецы) и резкие (рандомизированные пики DMP / ATAC) распределения серого фона (рис. 3D, E, GH). Действительно, как на длинных, так и на коротких плечах DMP и открывающиеся пики ATAC, связанные с переходом 1 (синее распределение), значительно ближе к 15 сбежавшим, чем по крайней мере один из их рандомизированных наборов перестановок.При последующих переходах реальная медианная пиковая дистанция DMP / ATAC постепенно приближается и в конечном итоге превосходит оба рандомизированных набора расстояний. В целом, прогрессивно увеличивающееся линейное расстояние от пиков DMP и ATAC до беглецов служит сильным предиктором того, какие гены с наибольшей вероятностью будут подвергаться XCE рано или поздно, что предполагает, что XCE, вероятно, будет распространяться непрерывным образом.

Терминал XCE связан с глобальным гипометилированием ДНК

В то время как первые три перехода в первую очередь повлияли на X, анализ ДНКме и экспрессии в масштабе всего генома выявляет возникающий и доминирующий эффект trans по мере того, как XCE приближается к завершению: относительно кластеров AD, hPSC Образцы кластера F демонстрируют значительное аутосомное гипометилирование по сравнению с другими кластерами и мужскими образцами (рис.4A). Это глобальное уменьшение ДНКме происходит параллельно с предвзятой регуляцией аутосомных генов (Fig. 4 B, C). Такие глобальные эффекты особенно поразительны по сравнению с относительно X-специфическими изменениями, происходящими на переходах 1-3, с некоторой ранней потерей аутосомной ДНК-мезы, начинающейся в переходе 4, и быстро усиливающейся при переходе 5 (рис. S3), когда множество DMPs по всему геному, чтобы уменьшить кумулятивную ДНК.

Рисунок 4: Глобальное гипометилирование и появившиеся маркеры наивной плюрипотентности в терминальном XCE

(A) Распределение аутосомного метилирования в кластерах женских hPSC (A-F, красные оттенки) и их K.S. расстояния относительно распределения мужских hPSC (бирюзовый).

(B) Хромосомно-разрешенные DMP конечных переходов XCE (4 или 5). Общее количество зондов, изменяющихся для аутосом, и X указаны цветами, соответствующими возрастанию (красный) или уменьшению (синий) ДНК. Прозрачность имеет непрерывную шкалу на основе β-дифференциала.

(C) Как (B), но с нанесением дифференциально экспрессируемых генов (DESeq2) с согласованными изменениями ДНК (B) и / или изменениями ATAC. Прозрачность имеет непрерывную шкалу, отражающую log2 (изменение кратности).

(D) Тепловая карта ДНКмэ зондов DUSP9 в кластерах A-F.

(E) DUSP9 (VST + пакетная коррекция / преобразование log2) в кластерах A-F.

(F) Переходные и аутосомные / X-разрешенные гены, дифференциально экспрессируемые, аннотированные в переписи раковых генов COSMIC ⁷⁹ .

(G) График разброса дифференциальной экспрессии переходных 4/5-специфичных генов (ось Y) по log2-кратным изменениям (ось X) этих генов между наивными и примированными hPSC из ⁶⁴ .

(H) Сравнение изменений экспрессии в переходных 4/5-специфических дифференциальных генах (темно-красный) относительно соответствующих изменений (серый) в наивных и праймированных hPSC из ⁶⁴ .

(I) Кумулятивные изменения (относительно кластера A) во всех дифференциально экспрессируемых HERV, идентифицированных телескопом ⁶⁷ (VST + пакетная коррекция / преобразование log2). Только значительно перепредставленные HERV (гипергеометрический p ≤ 0,1) отмечены цветами (остальные – серым). Цветная легенда показывает общее количество дифференциально выраженных классов HERV (гипергеометрическая значимость обозначена как * <.1, ** <.05, *** <. 01, **** <. 001).

(J) Совокупность дифференциально выраженных классов HERV (I) перекрывается значимо различающимися пиками ATAC (значение p справа по Фишеру обозначено как * <. 01, ** <.001, *** <. 0001). Отрицательные перекрытия указывают на перекрытия путем закрытия пиков ATAC, а положительные - путем открытия пиков.

В принципе, можно рассматривать две конкурирующие гипотезы этого эффекта: 1.) кластер F может состоять из аберрантных линий hPSC, которые страдают некоторой общей потерей факультативного гетерохроматина, или 2.) терминальный XCE специфически снижает глобальную ДНК-me, вероятно, за счет сверхэкспрессии X-сцепленных генов, которые влияют на ДНК-me в транс-. В качестве аргумента против первого, общая доступность аутосомного хроматина падает в переходе 4 с гораздо меньшим количеством открытий, чем закрывающих пиков (рис. S3), которые в основном находятся в редко доступных некодирующих областях и близких к клеточному типу сгруппированных семейств паралогичных генов (например, обонятельных рецепторов). , кератины, кадгерины). Напротив, и в поддержку последней гипотезы, гипометилирование XaXa мышиных ESCs по сравнению с 39, X и 40, XY клетками ранее было связано с двойной копией X-сцепленного гена Dusp9 ⁵⁸ .В соответствии с этим наблюдением образцы кластера F hPSC равномерно демонстрируют потерю ДНКме на промоторе DUSP9 , параллельную сверхэкспрессии DUSP9 в этом последнем переходе (фиг. 4D, E). В самом деле, аутосомная ДНКme сильно коррелирует с метилированием DUSP9 в мужских и женских hPSCs, но наклон этой взаимосвязи круче в контексте двух активных DUSP9 копий в кластере F hPSCs (Fig. S4A). Экспрессия мыши Dusp9 из двух активных копий в XaXa ESCs, как было показано, влияет на глобальную ДНКме путем ингибирования пути MAPK, что приводит к посттрансляционному снижению белков DNMT3A / B и UHRF1, которое не было очевидным в Dnmt3a / b и Uhrf1 уровней расшифровки ⁵⁸ .Аналогично, ни один человеческий ортолог не экспрессировался по-разному в образцах hPSC кластера F (не показано). Два дополнительных фактора, передающие сигнал через путь MAPK ( ELK1, , ^{, 59,} и ARAF, ), находятся в другой h4K9me3-богатой области hPSC Xi и увеличиваются примерно в 2 раза при потере связанной с промотором ДНК-мезоны (рис. D). Мы также проверили, активированы ли онкогены предпочтительно ^10,47 , но обнаружили лишь несколько истинных онкогенов , специфичных для последнего перехода на X ( ARAF, TFE3 ) и аутосом ( MET, NPM1, CD79B, POUF5F1). (OCT4), FLI1 ) одинаково (рис.4F). Соответственно, существует только один связанный с раком термин, обогащенный среди X-сцепленных генов, дифференциально экспрессируемых в переходе 5, что подрывает представление о том, что активация онкогена обеспечивает доминирующее селективное преимущество для hPSCs, подвергающихся раннему XCE.

Хотя ингибирование MAPK важно для in vitro индукции наивной плюрипотентности ^60,61 , оно также аннулирует глобальную ДНКме и стирает импринтинг ⁶² . Мотивированные наблюдением, что снижение ингибирования передачи сигналов MAPK является достаточным для наивной плюрипотентности ⁶³ , мы проверили, отражается ли умеренное ослабление уровней ДНКme в кластере F hPSC на различия в экспрессии их генов плюрипотентности.С этой целью мы сравнили профили экспрессии генов наивных и примированных hPSC, полученных параллельно ⁶⁴ , с генами, дифференциально экспрессируемыми в кластере F. Перекрытие (189/1686) и корреляция (rho = 0,67, p = 2,08e-21) между дифференциально экспрессируемые гены значительно превзошли наши ожидания (рис. 4G, H), с наивными факторами плюрипотентности DPPA2 / 3/5 и KLF4 , активизированными наряду с гомологией Кельча (KH) или генами, подобными домену KH NRLP7 и OOEP (также DPPA5 ).Более того, среди усиленных генов мы находим многие специфически экспрессируемые на трех эмбриональных стадиях до имплантации (зигота, морула и бластоциста), включая DDIT3, NANOG, POU5F1 (OCT4), TLE6 и ZSCAN4 , среди многих других. Активная регуляция этих генов значительно отражается в снижении ДНКме (рис. S4B, знаковый тест p <2.2e-16). Поскольку общая степень этих изменений отставала от динамического диапазона, наблюдаемого в настоящих наивных hPSC, мы также исследовали, были ли изменения в эндогенных ретровирусных элементах человека (HERV), которые выражаются в зависимости от стадии во время доимплантационного развития млекопитающих. и имеют сайты связывания фактора плюрипотентности в своих длинных концевых повторах (LTR) ^65,66 .Действительно, анализ ретротранскриптома с использованием телескопа ⁶⁷ показывает значительно повышенную регуляцию элементов HERV-H (LTR7Y p = 2,7e-4) и HERV-K (LTR5_Hs p = 0,003), которые соответственно связаны с эмбрионами на стадии бластоцисты и морулы. ⁶⁸ и аналогичным образом активируется в наивных hPSC in vitro ^60,63,66 . В то время как эти классы HERV также были значительно обогащены открытием пиков ATAC в кластере F (с 16 LTR7, двумя LTR7Y и шестью LTR5_Hs элементами), не наблюдалось наивной специфической для плюрипотентности позитивной регуляции или раскрытия хроматина у гоминидных SVA-элементов ^60,69 . hPSC (рис.4J). В целом, эти изменения указывают на то, что несмотря на их более ограниченное гипометилирование по сравнению с bona fide наивными hPSCs (Fig. 4H), кластерные F hPSCs, по-видимому, восстанавливают некоторые специфические признаки наивной плюрипотентности.

ОБСУЖДЕНИЕ

Наш интегрированный анализ ДНКм, ATAC и экспрессии направлен на решение трех основных проблем, которые затрудняют понимание нашего понимания XCE в женских hPSC на сегодняшний день: 1.) неполное представление о регуляции XIST человека, 2.) прогрессивное природа XCE в сочетании с отсутствием продольных исследований, и 3.), следовательно, широкий диапазон сообщаемых результатов, от частичной до полной реактивации Xi ^{10,33–38,70} . Заказывая более 200 образцов женского hPSC от раннего до позднего XCE, этот анализ приводит нас к четырем новым открытиям, касающимся этого неуловимого эпигенетического феномена.

Во-первых, мы определяем динамическое увеличение ДНКме и снижение доступности хроматина в cis- регуляторном CpG-островке всего на 1,2 т.п.н. ниже основного промотора XIST , что совпадает с потерей экспрессии XIST и самого раннего Xi. события реактивации (рис.2). Один и тот же элемент «P2» является одним из трех сайтов гиперчувствительности к ДНКазе, специфичным для женщин, на человеческом X и полностью метилирован на одном Xa в мужских клетках ^51,71 . Соответствующие DMP перекрывают консервативные родственные мотивы фактора транскрипции YY1, который связывается ДНК-м-чувствительным образом, повышая экспрессию XIST / Xist человека и мыши ⁴⁹ . Две столь же экономные причины потери экспрессии XIST могут заключаться в том, что продолжающийся отбор на высокую экспрессию факторов плюрипотентности, включая REX1 / ZFP42, который напрямую конкурирует за связывание мотива YY1 ⁴⁹ , или аберрантный MYC-опосредованный ДНКм в hPSC ⁷ , приведет к удалению YY1 из элемента P2.В самом деле, REX1 / ZFP42 необходим для плюрипотентности человека ⁷² и присоединяется к другому фактору плюрипотентности ( KLF4 ), который, как известно, репрессирует Xist у мышей ⁷³ , в прогрессивно увеличивающейся экспрессии через XCE (Fig. S2C, D). Из двух оставшихся женских кластеров YY1 на человеческом X ^51,71 , тандемный повтор FIRRE также отражает этот первый переход XCE с некоторыми из наиболее значительно увеличивающихся DMP и единственными закрывающимися пиками ATAC на X за пределами . XIST (рис.2,3). FIRRE , как было показано, формирует консервативные Xi-специфичные дальнодействующие взаимодействия с третьим специфическим для женщин кластером YY1, макросателлитом DXZ4 , который функционирует как топологическая граница на Xi (обзор в ⁵³ ). Оба этих некодирующих локуса тандемных повторов поддерживают фокальный эухроматин на длинном плече, в противном случае ускользнувшем, и располагаются в центре ( FIRRE ) или на периферии ( DXZ4 ) самых ранних кластеров реактивации (Рис. 3). Интересно, что прилегающая к DXZ4 15-мегабайтная область, как было показано, теряет h4K27me3, когда DXZ4 удаляется в дифференцированных клетках RPE-1 ⁵⁶ .Эта область также охватывает XACT , другой ген ncRNA, связанный с инициацией XCE в hESC H9 ³⁷ .

Во-вторых, помимо ассоциации h4K27me3 / h4K9me3, мы обнаруживаем, что линейное расстояние от генов беглецов является основным прогностическим фактором того, теряет ли данный ген DNAme и становится ли он более доступным во время ранней или поздней XCE (Рис. 3). С этой целью мы идентифицировали 15 кандидатов-беглецов в женских hPSC на основе их состояний ДНК, как у Cotton, et al. ⁵⁷ .На длинной руке новый кандидат в беглецы LHFPL1 (~ 1 Мб от XACT ), присоединился к PLS3-AS1 (~ 0,25 Мб от DXZ4 ) и FIRRE , а на короткой руке, за пределами PAR1 , двенадцать генов квалифицируются как «беглецы» на основании их ДНК. И на длинном, и на коротком плече DMP, связанные с более поздними переходами, увеличивались на расстоянии от этих кандидатов-беглецов, и это непрерывное распространение также проявлялось в прогрессивном увеличении доступности хроматина (рис.3А, Б). Этот паттерн напоминает коллинеарную активацию аутосомных кластеров HOX, которые репрессируются хроматином h4K27me3 и прогрессивно активируются по направлению к задней части эмбриона ⁷⁴ . Хотя мы не можем продемонстрировать причинно-следственную связь, одна правдоподобная механистическая основа для этого паттерна состоит в том, что активный хроматин распространяется от генов «беглецов», чтобы повторно активировать заглушенные гены непрерывным образом. В поддержку этого представления, делеция границы беглеца не отменяет его экспрессию на Xi мыши, но вместо этого запускает реактивацию соседних генов ⁷⁵ .В другом контексте реактивации X во время репрограммирования iPSC мыши гены, наиболее близкие к беглецам, также реактивируются раньше, чем дистальные гены ⁷⁶ .

В-третьих, терминальный XCE поразительно связан со специфическим для самок глобальным гипометилированием ДНК (Fig. 4A, B, C), как ранее было продемонстрировано на XaXa ESCs ⁵⁸ мыши. Как и в системе мышей, мы обнаружили, что удвоение дозы DUSP9 , специфичное для конечного перехода XCE, коррелирует с аутосомным гипометилированием (рис.S4A). Мы находим мало доказательств преимущественной регуляции онкогенов перед терминальным XCE, когда активируются два X-сцепленных и пять аутосомных онкогенов (Fig. 4F). Таким образом, мы заключаем, что отбор женских hPSCs, подвергающихся XCE, вряд ли приведет к раннему XCE. Удивительно, но в терминальном XCE, когда реактивация DUSP9 нарушает путь MAPK и сокращается ДНК-мез во всем геноме, мы обнаруживаем очень значительный сдвиг в сторону профиля экспрессии наивного плюрипотентного гена, поскольку праймированные маркеры репрессируются, а наивные маркеры индуцируются (рис. .4G, H). В то время как величина индукции наивных маркеров отстает от наблюдаемой для настоящих наивных hPSC, реактивированные и повторно открывающиеся HERV (рис. 4I, J) соответствуют in vivo эквивалентным классам HERV на стадии до имплантации, а именно HERV-H (бластоциста). ) и HERV-K (morula) ⁶⁸ . Этот профиль HERV также активируется либо временно во время перепрограммирования ИПСК ⁷⁷ , либо стабильно при индукционной наивной плюрипотентности ^60,63 . В ESCs мыши двойные блоки дозировки Х-хромосомы выходят из наивной плюрипотентности ¹⁶ , вероятно, за счет стабилизации экспрессии специфических регуляторов плюрипотентности ⁷⁸ .В результате выход плюрипотентности связан с XCI. Таким образом, мы интерпретируем базальную индукцию наивно-специфических генов и HERV в терминальном XCE (рис. 4) как hPSCs, частично воспроизводящие этот процесс в обратном порядке, предполагая сохранение этого воздействия двойной дозы X на наивную цепь плюрипотентности человека. Интересно, что обогащение активированных митохондриальных факторов и регуляторов окислительного фосфорилирования в терминальном XCE может указывать на возможную связь с третьим отличительным признаком наивной плюрипотентности, а именно усилением митохондриального дыхания ⁶⁴ .

Заглядывая вперед, этот анализ поднимает важные вопросы для будущей работы относительно возможных ролей REX1 / ZFP42 или аберрантной ДНКме в вытеснении YY1 из элемента P2 XIST, а также чувствительности FIRRE и DXZ4 к одной и той же цепи плюрипотентности, или реагировать на самые ранние структурные изменения Xi при потере XIST . Более того, если эухроматические регионы действительно реактивация X семени, возможно ли, что FIRRE и DXZ4 были консервативными в процессе эволюции из-за нехватки генов беглеца на длинном плече X человека? Хотя ни один из их мышиных ортологов не требуется для XCI in vivo , их потенциальные роли в реактивации X еще предстоит детально рассмотреть.Высокая плотность беглецов и активный PAR1 также могут предрасполагать короткое плечо Xi человека к XCE, что может объяснить, почему hPSCs зависят от XIST для поддержания XCI, в отличие от мышиной системы. Принимая во внимание потенциальное применение клеток, полученных из hPSC, для моделирования заболеваний и терапии замещения аутологичных клеток, было бы также важно установить, останавливается ли ранний или промежуточный XCE после дифференцировки или прогрессирует после нее. Наконец, определение того, какие факторы, связанные с Х-хромосомой, помимо DUSP9 , могут быть необходимыми и достаточными для запуска специфичного для женщин гипометилирования в hPSC, представляет собой важную цель для понимания того, почему смещение дозировки женщин / Ха в сторону наивной плюрипотентности могло сохраняться в эволюции ^16,78 .

ВЗНОС АВТОРА

P.B. собрал, обработал и проанализировал все данные. П. Б. и S.F.P. задумал исследование, интерпретировал результаты и написал рукопись.

ДЕКЛАРАЦИЯ ИНТЕРЕСОВ

Отсутствие конкурирующих интересов

МЕТОДЫ

Сбор, обработка и нормализация данных

Мы провели поиск в GEO данных Illumina 450K и 850K Methylation Array на предмет недифференцированных ИПСК и ЭСК человека, по крайней мере, с десятью образцами. , в результате чего получено восемь исследований с 281 выборкой женщин и 190 выборками мужчин ^38,40–46 .В большинстве исследований были доступны предварительно обработанные данные о метилировании. Остальные мы обработали с помощью метода IlluminaNormalization от minfi, чтобы имитировать предварительно обработанные данные ⁸⁰ , и объединили данные массивов метилирования 850K и 450K в зонды, которые были общими в обоих массивах. Мы также удалили все перекрестно-реактивные зонды, как идентифицировано Chen et al, чтобы исключить неоднозначные сигналы метилирования ⁸¹ . Далее мы картировали все зонды в сборку генома hg38 с помощью BLAT и удалили все зонды, которые были картированы в нескольких областях генома ⁸² .После этой обработки в геноме было 413 491 зонда, в том числе 9 191 зонда на X.

Картирование зондов в построение генома hg38 также обеспечило обновленные аннотации генов. Ген был назначен зонду, если зонд находился в пределах 5 килобайт от гена. Затем зонд был аннотирован как «OutsideTranscript5» (от -5000 до -1500 TSS), «TSS1500» (от -1500 до -200 TSS), «TSS200» (от -200 до 0 TSS), «5_UTR» ( в 5 ‘UTR гена), «Body» (в теле гена, включая экзоны и интроны), «3_UTR» (в 3’UTR гена) и «OutsideTranscript3» (5 КБ после конца ген).Все позиции были аннотированы в соответствии с каноническим транскриптом для гена, который был определен как самый высокий уровень поддержки транскрипта (TSL) или самый высокий уровень APPRIS, как аннотировано Ensembl ⁸³ . TSL отмечает объем литературной поддержки, стоящей за стенограммой, в то время как APPRIS отмечает функциональную важность стенограммы.

Используя оставшиеся пробы, мы выполнили прогнозирование пола с помощью minfi и удалили все строки, в которых прогнозируемый пол не соответствовал аннотированному полу.В случаях, когда аннотированный пол не был доступен в исходном исследовании метилирования, его получали от целлозавра и сравнивали с предполагаемым полом ⁸⁴ . Затем мы выполнили PCA-анализ зондов X-хромосомы отдельно для мужских и женских образцов, чтобы определить, что данные были достаточно нормализованы для количественного сравнения исследований (рис. S1A). Среди женских выборок hESC H9 были чрезмерно представлены в данных и имели тенденцию отделяться от большинства других женских hPSC.Чтобы не искажать наш анализ различиями между H9 и другими линиями клеток, мы удалили все 60 образцов H9 из нашего анализа (рис. S1B, C). Для мужских образцов было удалено 12 выбросов в PCA (рис. S1D, E). В результате мы получили 221 женскую выборку и 178 мужскую выборку.

Кластеризация образцов по вариативным зондам

Чтобы вычислить, какие сайты имели большую дисперсию в женских выборках, чем мужские выборки, мы выполнили тест Брауна Форсайта (BF) для каждого зонда матрицы метилирования, чтобы вычислить статистическую значимость разницы в дисперсии для зонд между женскими и мужскими образцами.Тест BF установил статистическую значимость различий в вариациях для каждого зонда между выборками самок и самцов. BF альфа был намного более значимым для X-зондов, чем для аутосомных зондов (рис. S1G). Значительно больше вариантов X-зондов также имеют более низкую ДНКme, чем сайты без сигнатуры (рис. S1H). Мы выбрали X-связанные сайты, которые имели большую дисперсию в женских выборках, чем мужские (BF p-value ≤ 0,01), и выполнили взвешенный кластерный анализ k-средних с использованием библиотеки python scikit-learn для женских выборок ⁸⁵ .Веса для кластеризации k-средних были основаны на том, сколько клеточных линий было включено в анализ, чтобы небольшие различия в количестве образцов на клеточную линию не искажали вычисления k-средних. Мы использовали метод локтя, чтобы определить подходящее количество кластеров около шести. Затем эти кластеры были обозначены A-F на основании их среднего метилирования Х-хромосомы (от максимального до наименее метилированного). Репрезентативные изображения того, как кластеры разделяют образцы в PCA, показаны на рис.S1K для k = 4-8.

Кластеризация зондов по прогрессу XCE

Сгруппировав и упорядочив образцы, мы проанализировали, как зонды X-хромосомы менялись во время XCE. Используя функцию dmpFinder пакета minfi, мы обнаружили дифференциально метилированные зонды между каждым соседним кластером образцов. Затем мы разделили каждый сайт CpG на X-хромосоме на одну из 11 групп (рис. 1F, ось y) на основе наиболее статистически значимого перехода (наименьшее значение p ≤ 0,05) и того, был ли переход увеличением метилирования. или снижение метилирования для сайта.Эти кластеры обозначены на рисунке 1F номером перехода, в котором они меняются, и стрелкой, показывающей увеличение (↑) или уменьшение (↓) метилирования. Последний кластер (помеченный «~») содержит зонды, которые не проходят пороговое значение p-значения (0,05) для всех тестов DMP и, следовательно, не считаются изменяющимися во время XCE.

Анализ ATAC-seq

Мы выровняли файлы Fastq ATAC-seq с помощью esATAC, который служит оболочкой для AdapterRemoval ⁸⁶ для обрезки адаптера и Bowtie2 ⁸⁷ для выравнивания чтения.MACS2 ⁸⁸ использовался для пикового вызова, а DiffBind ⁸⁹ использовался для дифференциального анализа пиков. Дифференциальный анализ проводили с использованием границ кластера, как и для анализа дифференциального метилирования DMP.

Кумулятивное деметилирование и расчет корреляции с Xi-специфичными гистоновыми метками

Для расчета кумулятивных изменений метилирования (серые области на рис. 3A) мы усреднили в окне все зонды, которые прошли пороговое значение p (≤ 0,05), по крайней мере, в один переход и вычислили разницу в метилировании по сравнению с кластером A, движущимся через переходы.Напротив, зонды, которые не прошли порог, имели более флуктуирующие изменения ДНКме, которые не накапливались в последовательных переходах (рис. S2B).

Мы рассчитали корреляцию изменений XCE DNAme с Xi-специфическими пиками h4K27me3 и h4K9me3 из ³⁷ . Так как эти пики уже были усреднены по окнам в файлах гео-пластов, мы решили разместить наши данные DNAme в тех же окнах (окна размером 100 Кб каждые 50 Кб). Мы использовали изменения, характерные для перехода (цветные линии на рис. 3A), чтобы вычислить корреляцию Пирсона для каждого перехода (рис.3С). Точно так же мы обработали окна дифференциальными пиками ATAC (рис. 3B) и рассчитали корреляцию Пирсона для каждого перехода (рис. 3F).

Аннотирование генов как беглецов

Мы аннотировали гены Х-хромосомы как избегающие XCI, используя метод вызова беглецов на основе ДНКм, представленный Коттоном и др. ⁵⁷ (рис. S2E-G). Мы использовали все мужские образцы и женские образцы из кластера А для выполнения этого анализа. Во-первых, мы удалили все зонды Х-хромосомы со средним метилированием> =.25 в мужских выборках. Чтобы вычислить среднее значение DNAme для каждого гена, мы использовали TSS для канонического транскрипта и усреднили все оставшиеся зонды, которые находились между -500 и +1500 TSS. Мы рассчитали среднее метилирование TSS отдельно для мужских и женских образцов кластера А. Оценивая гены, определенные как обучающий набор беглецов, согласно Коттону и др., И используя тот же метод проверки, мы обнаружили, что только 4/12 их «беглецов из обучающего набора» действительно избежали XCI в нашем наборе данных ( CA5B, SYAP1, ZFX , и ЗРСР2 ).У них было среднее метилирование женщин кластера А 0,106 и средняя половая разница 0,02. Ген классифицируется как беглец, если его ДНК-самка меньше среднего женского ДНКме + (3 * S.D. female DNAme), и если его половая разница меньше, чем средняя половая разница + (3 * S.D. Половая разница). В целом этот подход идентифицировал 15 генов беглеца (показаны на рис. 3А): 12 на коротком плече и 3 на длинном плече X. Мы проверили различия в метилировании в промоторе и теле гена для генов беглеца и субъекта, и обнаружили, что гены беглецов имеют тенденцию иметь сильно деметилированные промоторы и тела гена метилирования на обеих хромосомах, тогда как гены-субъекты имеют бимодальное распределение ДНКме как в теле гена, так и в промоторе (рис.S1H).

Расчет расстояний до генов беглецов

Мы рассчитали расстояние между зондами эрозии ДНКме и генами беглецов, чтобы проверить, исходит ли эрозия от беглецов. Для каждого DMP, назначенного переходу, мы рассчитали расстояние до ближайшего гена беглеца. Мы оценили короткое и длинное плечо Х-хромосомы отдельно из-за несоответствия в количестве беглецов на каждом плече. Кроме того, мы выполнили два теста на перестановку, чтобы получить рандомизированные распределения, с которыми можно сравнить специфичные для переходов распределения фактических минимальных расстояний.Один тест рандомизировал метки беглецов по всем генам, представленным зондами, а другой рандомизировал метки перехода для каждого DMP. Каждый тест повторялся 1000 раз для каждого перехода и каждого плеча хромосомы для получения окончательных распределений (рис. 3D, E). Мы повторили этот анализ с дифференциальными пиками ATAC вместо DMP (рис. 3G, H).

Анализ экспрессии

Из 221 проанализированных нами женских клеточных линий (после удаления H9) у 47 были доступны данные последовательности РНК. Данные последовательности РНК были загружены с помощью SRA Toolkit.Файлы FASTQ были выровнены по сборке генома hg38 (с областью PAR, замаскированной на Y-хромосоме) с использованием STAR, и считывания были подсчитаны с использованием HTSeq-count ^90,91 .

Анализ дифференциальной экспрессии (DE) выполняли с использованием DESeq2 ⁹² . Мы исключили гены с менее чем 10 счетами. DE выполняли на основе кластеров образцов, полученных из метилирования, и выполняли индивидуально для каждого перехода, а не рассматривали назначения кластеров как непрерывную переменную.Дифференциальное выражение вычислялось между каждой границей со всеми образцами. Например, в анализе перехода 1 мы назначили образцы кластера A как одну группу, а кластеры B-F как другую, а затем идентифицировали дифференциально экспрессируемые гены с помощью DESeq2. Для перехода 2 мы сравнили кластеры A-B с кластерами C-F. Для перехода 3 мы сравнили A-C с D-F. Поскольку не было доступных данных экспрессии для образцов в кластере E, мы объединили переход 4/5 в один и сравнили кластеры A-D с кластером F.Рассматривая все образцы, мы отфильтровали дифференциально экспрессируемые гены, которые не претерпевают постоянных / постоянных изменений на протяжении XCE. Мы также использовали DESeq2 для извлечения нормализованной экспрессии VST для XIST, FIRRE, DUSP9, ELK1, REX1 и KLF4 , а затем выполнили пакетную коррекцию limma для корректировки различий в данных RNA-seq из разных групп. Преобразование VST применяет преобразование псевдо-log2 к счетчикам. Эти VST и значения с пакетной коррекцией используются для всех графиков выражений.

Анализ конкордантности и обогащения

Мы пометили ген с конкордантным метилированием и экспрессией как тот, у которого, по крайней мере, один зонд матрицы метилирования, изменяющийся в том же переходе, что и экспрессия, и имеющий направление изменения, противоположное выражению (т. Е. Уменьшение метилирования для экспрессия генов увеличивается, и наоборот). Мы также позволили гену считаться конкордантным, если он имеет дифференциальный пик ATAC с +/- 3kb изменения гена в том же переходе, что и изменение экспрессии (все конкордантные гены показаны на рис.S3C). Чтобы проверить соответствие между экспрессией и ATAC-seq, мы просто проверили, что дифференциальные пики ATAC находятся в пределах 3kb от гена. Гены, которые были либо согласованы с ДНКме, либо с пиками ATAC, показаны на рисунке S3C.

Используя эти конкордантные наборы генов, специфичные для переходов, мы вычислили обогащение терминов онтологии при каждом переходе для генов Х-хромосомы и аутосомных генов. Используя пакет clusterProfiler R, мы запросили следующие наборы генов: Disease Ontology, DisGeNET, GO, KEGG, MeSH gendoo, MSigDB, Network of Cancer Gene, Reactome и WikiPathways.Для подсчета генов рака (рис. 4F) мы использовали COSMIC Cancer Gene Census, чтобы подсчитать, сколько генов рака различных типов было в каждом переходе ⁷⁹ .

Анализ HERV с помощью телескопа

Мы использовали Telescope ⁶⁷ для подсчета выражения HERV для каждого выровненного по STAR файла BAM из анализа выражения. Затем мы использовали тот же конвейер DESeq2 из анализа экспрессии, чтобы вычислить дифференциальное выражение HERV между кластерами и получить преобразованное в лог2 выражение VST + с пакетной коррекцией для каждого образца.

Анализ перекрытия ATAC HERV

Используя bedtools fisher, мы сравнили перекрытие для каждого повтора из RepeatMasker и наши дифференциальные пики ATAC от каждого перехода. Мы использовали правостороннее значение p для выбора перекрытий, которые были обогащены нашими дифференциальными пиками ATAC. На рис. 4J показаны значимые перекрытия для HERV, которые также дифференциально экспрессировались в переходе 4/5 (рис. 4I).

ДОПОЛНИТЕЛЬНЫЕ ОБОЗНАЧЕНИЯ НА РИСУНКЕ

Рисунок S1: Обработка данных DNAme для различения кластеров вдоль XCE

(A) Схема конвейера фильтрации и обработки данных метилирования ДНК.

(B) и (C) PCA женских образцов на X-зондах до и после удаления H9, соответственно. Графики окрашены в зависимости от свойств образцов, обозначенных легендами.

(D) и (E) PCA мужских образцов на X-зондах до и после удаления выбросов соответственно. Графики окрашены в зависимости от различных свойств образцов, обозначенных легендами.

(F) Глобальное среднее метилирование для женских и мужских образцов (N.S. = не значимо).

(G) Значения p теста Брауна-Форсайта для аутосомных зондов и X-зондов, показывающие, что X-зонды значительно более разнообразны между мужскими и женскими образцами, чем аутосомные зонды.

(H) Распределение ß-значений для X-зондов, которые более вариативны в женских выборках (Sig Sites), и тех, которые не являются Sig-сайтами (Non-sig-sites).

(I) и (J) Взаимосвязь между средним метилированием Х-хромосомы и средним метилированием не-sig-x-зондов или sig-x-зондов, соответственно. Линия показывает линейную регрессию, а «corr» – корреляция Пирсона.

(K) Графики метода локтя, чтобы найти подходящее количество кластеров для кластеризации k-средних женских выборок.

Рисунок S2: Динамика ДНКме во время XCE позволяет различать «беглецов» и реактивированные гены

(A) Процентный состав зондов в каждой группе зондов на Рисунке 2A, как описано в методах. Итоговые значения датчиков для каждой группы указаны справа.

(B) Кумулятивные изменения при каждом переходе для X-сцепленных зондов с высокой вариабельностью по полу, но без согласованного направления переходов (символ «~»), нанесены на график, как на рис. 3A.

(C) и (D) VST + выражение с пакетной коррекцией для REX1 и KLF4 соответственно. REX1 имеет 2 выброса, скрытых на точечной диаграмме для облегчения визуализации коробчатой ​​диаграммы.

(E-G) Идентификация беглецов по методу Коттона и др. Панели «Дельта пола» показывают разницу в метилировании гена между мужскими и женскими образцами. (E) значения метилирования исходных Cotton, et al. гены стажеров, (F) как G после удаления начальных генов стажеров, не отвечающих критериям отсечения (как у Коттона и др.), и (G) конечный набор генов беглецов после определения истинного назначения и идентификации беглецов.

(H) Распределение значений β для тела гена и промоторных зондов для беглецов и генов, подверженных XCI.

(I) Кумулятивная вероятность деметилирования CpG при каждом переходе как функция расстояния до генов «беглецов» на всей Х-хромосоме.

(J) как в K, исключительно для CpG на коротком плече.

(K) как в K, исключительно для CpG на длинной руке.

(L) Кумулятивная вероятность раскрытия пика ATAC при каждом переходе как функция расстояния до генов «убегающих» на всей Х-хромосоме.

(M) как в L, исключительно для пиков ATAC на коротком плече.

(N) как в L, исключительно для пиков ATAC на длинном плече.

Рисунок S3: Глобальные изменения ДНКме и экспрессии генов

(A) Разрешенные хромосомы DMP, назначенные конкретным переходам по значению p. Приведены общие подсчеты для аутосомных и Х-хромосомных зондов с указанием направления изменения (синий = потеря ДНКме и красный = увеличение ДНКме). Прозрачность имеет непрерывную шкалу на основе β-дифференциала.

(B) Дифференциальные пики ATAC с разрешением хромосом, присвоенные определенным переходам с помощью FDR. Общие подсчеты представлены как для (A) (синий = закрытие пика ATAC, красный = открытие пика ATAC). Прозрачность имеет непрерывную шкалу, основанную на log2 (кратном изменении) пиков ATAC.

(C) Дифференциально экспрессируемые гены с разрешенной хромосомой, согласующиеся либо с пиками DMP (A), либо с дифференциальными пиками ATAC (B). Общие подсчеты представлены как для (A) (синий = убывающее выражение, красный = возрастающее выражение).